name: Создание и анализ экспрессионных карт Arabidopsis thaliana и Capsella bursa-pastoris
keyword_list: Arabidopsis thaliana, Capsella bursa-pastoris, экспрессия, эволюция, функциональный анализ
abstract: В работе «Создание и анализ транскриптомных карт Arabidopsis thaliana и Capsella bursa-pastoris» были продемонстрированы возможности высокоразрешенных атласов экспрессии генов для функционального и эволюционного анализа. Была создана транскриптомная карта A. thaliana, содержащая 79 образцов органов и частей растения на разных стадиях развития, и определены основные характеристики транскриптома A. thaliana, найдены наиболее стабильно экспрессирующиеся гены, применимые в качестве референсов в ОТ-ПЦР в реальном времени, и изучены паттерны экспрессии транскрипционных факторов. Изучение временной серии апикальных меристем позволило обнаружить синхронную экспрессию генов, связанных с клеточным циклом, при переходе к цветению, что, вероятно, вызвано укорочением клеточного цикла на этой стадии развития. Было показано наличие органоспецифичной части ответа на холодовой стресс. Анализ атласа аллотетраплоида C. bursa-pastoris позволил подтвердить отсутствие геномного доминирования и сделать предположение о причинах возникновения различий в уровнях экспрессии гомеологов. Данные были подготовлены для помещения в базу данных TraVA.
chairman_dissertation_council.surname: Рубцов Н.Б.
chairman_dissertation_council.position: зам. председателя
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
organization_supervisor.surname: Куценогий П.К.
organization_supervisor.position: зам. директора
organization_supervisor.degree: Кандидат физико-математических наук
rubrics.code: 34.15.23
rubrics.name: Молекулярная генетика
rubrics.code: 34.23.29
rubrics.name: Генетика развития
rubrics.code: 34.03.23
rubrics.name: Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
oecds.code: 01.06.MC
oecds.name: MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
oecds.code: 01.06.KM
oecds.name: GENETICS & HEREDITY
oecds.code: 01.06.HY
oecds.name: DEVELOPMENTAL BIOLOGY
speciality_codes.name: Генетика
speciality_codes.code: 03.02.07
speciality_codes.name: Математическая биология, биоинформатика
speciality_codes.code: 03.01.09
supervisors.fio: Пенин А.А.
supervisors.scientific_degree: Кандидат биологических наук
supervisors.speciality_code: Генетика
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Голденкова-Павлова И.В.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Генетика
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Землянская Е.В.
opponents.scientific_degree: Кандидат биологических наук
opponents.speciality_code: Молекулярная биология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИЦиГ СО РАН
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»
protection_organization.ogrn: 1025403657410
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ИППИ РАН
author_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича Российской академии наук
author_organization.ogrn: 1037700064940
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения