name: Применение методов машинного обучения для разработки новых молекул с антибактериальной активностью
keyword_list: АНТИБАКТЕРИАЛЬНЫЙ, МАЛЫЕ МОЛЕКУЛЫ, МАШИННОЕ ОБУЧЕНИЕ, РАЗРАБОТКА ЛЕКАРСТВ
abstract: Цель: разработка компьютерной модели для прогнозирования антибактериальной активности малых молекул. Специальным образом сформирована обучающая выборка. Для ее набора применен специальный подход к виртуальному скринингу молекул, максимизирующий их структурное разнообразие по ряду параметров, в том числе учитывающих их 3D-конформацию. Эффективность модели исследована с использованием независимой валидационной выборки, в которую были включены структуры с коэффициентом подобия Танимото, не превышающим 0,5 по отношению к обучающим примерам. Несколько молекул продемонстрировали высокую антибактериальную активность и подавляли трансляцию in vitro и in vivo. Для лучших соединений определены значения минимальной ингибирующей концентрации и цитотоксичности (CC50), позволяющие оценить индекс селективности. Многие обнаруженные активные соединения не встречаются в патентной литературе и научных публикациях.
chairman_dissertation_council.surname: Чупин В.В.
chairman_dissertation_council.position: главный научный сотрудник
chairman_dissertation_council.degree: Доктор химических наук
organization_supervisor.surname: Кудрявцев Н. Н.
organization_supervisor.position: ректор
organization_supervisor.degree: Доктор физико-математических наук
rubrics.code: 34.17.03
rubrics.name: Теоретическая и математическая биофизика
oecds.code: 01.06.00
oecds.name: Biological sciences
speciality_codes.name: Биофизика
speciality_codes.code: 03.01.02
supervisors.fio: Иваненков Я.А.
supervisors.scientific_degree: Кандидат биологических наук
supervisors.speciality_code: Биохимия
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: -
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: -
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: МФТИ
protection_organization.name: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Московский физико-технический институт (национальный исследовательский  университет)"
protection_organization.ogrn: 1027739386135
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные автономные учреждения
author_organization.short_name: МФТИ
author_organization.name: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Московский физико-технический институт (национальный исследовательский  университет)"
author_organization.ogrn: 1027739386135
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные автономные учреждения