name: Эволюционно-генетический сигнал отрицательного отбора и рекомбинации в полногеномных данных
keyword_list: сравнительная геномика отрицательный отбор эпистаз рекомбинация
abstract: В работе представлены результаты поиска сигнала отрицательного отбора и рекомбинации в различных геномных данных. С помощью анализа имеющих общее происхождение интронов в четверках видов в работе был выявлен сигнал, свидетельствующий о том, что действие отрицательного отбора на ортологичные интроны может продолжаться даже тогда, когда сходство на уровне последовательностей между такими интронами в далеких видах уже утрачено. На основании анализа однонуклеотидных полиморфизмов в геномах Drosophila melanogaster получены свидетельства, указывающие на вероятное действие синергического эпистатического отбора на вредные аллели в популяциях этого вида. Присутствие подписи синергических эпистатических взаимодействий у D. melanogaster было показано для аллелей, вызывающих потерю функции гена, а также для подмножества несинонимических аллелей, попадающих в гены, находящиеся под сильным отрицательным отбором. В работе впервые на полногеномных данных выявлен сигнал рекомбинации и обмена генетическим материалом для вида, относящегося к группе бделлоидных коловраток. Геномные подписи, указывающие на существование рекомбинации у бделлоидных коловраток, не могут быть объяснены исключительно за счет генной конверсии и, вероятно, являются результатом реципрокной рекомбинации. Получены указания на то, что половое размножение является более вероятным объяснением обмена генетическим материалом и рекомбинации в популяциях бделлоидных коловраток, чем горизонтальный перенос генов.
chairman_dissertation_council.name: Михаил
chairman_dissertation_council.surname: Гельфанд
chairman_dissertation_council.patronymic: Сергеевич
chairman_dissertation_council.position: зав. лабораторией
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
chairman_dissertation_council.rank: Профессор
chairman_dissertation_council.wos_research_id: F-3425-2012
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 7201803297
chairman_dissertation_council.rinc_id: 108178
chairman_dissertation_council.orcid: 0000-0003-4181-0846
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Андрей
organization_supervisor.surname: Соболевский
organization_supervisor.patronymic: Николаевич
organization_supervisor.position: и.о. директора
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.03.23
rubrics.name: Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
rubrics.code: 34.15.29
rubrics.name: Молекулярная эволюция
oecds.code: 01.06.MC
oecds.name: MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
oecds.code: 01.06.HT
oecds.name: EVOLUTIONARY BIOLOGY
speciality_codes.name: Математическая биология, биоинформатика
speciality_codes.code: 1.5.8.
supervisors.fio: Базыкин Г.А.
supervisors.scientific_degree: Доктор биологических наук
supervisors.speciality_code: Математическая биология, биоинформатика
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Трифонов В.А.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Молекулярная генетика
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Медведева Ю. А.
opponents.scientific_degree: Кандидат биологических наук
opponents.speciality_code: Молекулярная биология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИППИ РАН
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича Российской академии наук
protection_organization.ogrn: 1037700064940
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ИППИ РАН
author_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт проблем передачи информации им. А.А. Харкевича Российской академии наук
author_organization.ogrn: 1037700064940
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения