name: Компьютерные методы высокопроизводительного фенотипирования растений
keyword_list: пшеница базы данных анализ цифровых изображений экспериментально-компьютерная платформа высокопроизводительное фенотипирование
abstract: Разработана экспериментально-компьютерная платформа ICGPhenoPlant для высокопроизводительного фенотипирования растений на основе анализа цифровых изображений и изучение с ее помощью взаимосвязи признаков фенотипа растений с генотипом и ответом на воздействие окружающей среды. Платформа включает приложения: LHDetect2 для оценки количественных характеристик опушения листьев пшеницы, картофеля и табака; SeedСounter для оценки признаков размера, формы и цвета оболочки зерен пшеницы; WERecognizer для оценки характеристик размера и формы колоса пшеницы. Разработаны базы данных WheatPGE и SpikeDroid для хранения данных о фенотипе, генотипе и месте произрастания растений пшеницы в процессе селекционно-генетического эксперимента. Разработанная система позволила провести анализ связи фенотипа и генотипа для признаков опушения листьев пшеницы, признаков зерен пшеницы в популяции ITMI, разработать описание характеристик колосьев пшеницы в базе данных SpikeDroid.
chairman_dissertation_council.name: Владимир
chairman_dissertation_council.surname: Шумный
chairman_dissertation_council.patronymic: Константинович
chairman_dissertation_council.position: Председатель
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
chairman_dissertation_council.rank: Академик
chairman_dissertation_council.wos_research_id: -
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 6603898963
chairman_dissertation_council.rinc_id: 8554
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Алексей
organization_supervisor.surname: Кочетов
organization_supervisor.patronymic: Владимирович
organization_supervisor.position: директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.03.23
rubrics.name: Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
rubrics.code: 34.23.57
rubrics.name: Генетика и селекция растений
rubrics.code: 50.53.17
rubrics.name: Автоматизация сбора и обработки данных научного эксперимента
oecds.code: 01.02.EV
oecds.name: COMPUTER SCIENCE, INTERDISCIPLINARY APPLICATIONS
oecds.code: 01.06.DE
oecds.name: PLANT SCIENCES
oecds.code: 01.06.KM
oecds.name: GENETICS & HEREDITY
speciality_codes.name: Математическая биология, биоинформатика
speciality_codes.code: 1.5.8.
supervisors.fio: Колчанов Н.А.
supervisors.scientific_degree: Доктор биологических наук
supervisors.speciality_code: Математическая биология, биоинформатика
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Карлов Г.И.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Генетика
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Самсонова М.Г.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Математическая биология, биоинформатика
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Ракутько С.А.
opponents.scientific_degree: Доктор технических наук
opponents.speciality_code: Электротехнологии и электрооборудование в сельском хозяйстве
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИЦИГ СО РАН
protection_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ НАУЧНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР ИНСТИТУТ ЦИТОЛОГИИ И ГЕНЕТИКИ СИБИРСКОГО ОТДЕЛЕНИЯ  РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК"
protection_organization.ogrn: 1025403657410
protection_organization.supervisor_name: АЛЕКСЕЙ
protection_organization.supervisor_surname: КОЧЕТОВ
protection_organization.supervisor_patronymic: ВЛАДИМИРОВИЧ
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ИЦИГ СО РАН
author_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ НАУЧНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР ИНСТИТУТ ЦИТОЛОГИИ И ГЕНЕТИКИ СИБИРСКОГО ОТДЕЛЕНИЯ  РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК"
author_organization.ogrn: 1025403657410
author_organization.supervisor_name: АЛЕКСЕЙ
author_organization.supervisor_surname: КОЧЕТОВ
author_organization.supervisor_patronymic: ВЛАДИМИРОВИЧ
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения