name: Особенности трехмерной организации хроматина у представителей комаров рода Anopheles
keyword_list: структура хроматина род Anopheles петли хроматина метод Hi-C 3D-организация генома малярийные комары
abstract: Диссертационная работа посвящена исследованию пространственной организации генома у малярийных комаров. Целью работы стала характеристика и выявление особенностей пространственной организации хроматина у пяти видов Anopheles (Anopheles coluzzii, An.merus, An.stephensi, An.atroparvus и An.albimanus). Был разработан новый протокол метода захвата конформации хромосом (Hi-C), оптимизированный для применения на эмбрионах Anopheles, который позволяет проводить поиск и анализ хромосомных перестроек. С его использованием были улучшены сборки пяти геномов малярийных комаров. Был проведён детальный анализ тепловых карт пространственных контактов их геномов, выявлены и охарактеризованы ключевые структуры пространственной организации - хромосомные территории, компартменты, хроматиновые домены и петли хроматина. Было показано, что основные принципы укладки хроматина малярийных комаров, за исключением формирований дальних хроматиновых петель, демонстрируют сходство с укладкой генома к рода Drosophila. Особенностью рода Anopheles является наличие небольшого числа (<10) дальних петель хроматина - участков генома, контактирующих в пространстве ядра, но расположенных на больших расстояниях (>103 т.п.о.) в линейном геноме. Полученные данные могут быть использованы для изучения эпигенетических механизмов на хромосомном уровне у Anopheles, а также при решении практических задач, связанных с анализом инверсионных полиморфизмов у малярийных комаров и их распространением в природных популяциях.
chairman_dissertation_council.name: Владимир
chairman_dissertation_council.surname: Шумный
chairman_dissertation_council.patronymic: Константинович
chairman_dissertation_council.position: Председатель
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
chairman_dissertation_council.rank: Академик
chairman_dissertation_council.wos_research_id: -
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 6603898963
chairman_dissertation_council.rinc_id: 8554
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Алексей
organization_supervisor.surname: Кочетов
organization_supervisor.patronymic: Владимирович
organization_supervisor.position: директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.23.23
rubrics.name: Цитогенетика
rubrics.code: 34.15.23
rubrics.name: Молекулярная генетика
oecds.code: 01.06.DR
oecds.name: CELL BIOLOGY
speciality_codes.name: Клеточная биология
speciality_codes.code: 1.5.22.
supervisors.fio: Фишман В.С.
supervisors.scientific_degree: Кандидат биологических наук
supervisors.speciality_code: Генетика
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Романенко С.А.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Генетика
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Храмеева Е.Е.
opponents.scientific_degree: Кандидат биологических наук
opponents.speciality_code: Математическая биология, биоинформатика
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИЦИГ СО РАН
protection_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ НАУЧНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР ИНСТИТУТ ЦИТОЛОГИИ И ГЕНЕТИКИ СИБИРСКОГО ОТДЕЛЕНИЯ  РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК"
protection_organization.ogrn: 1025403657410
protection_organization.supervisor_name: АЛЕКСЕЙ
protection_organization.supervisor_surname: КОЧЕТОВ
protection_organization.supervisor_patronymic: ВЛАДИМИРОВИЧ
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ИЦИГ СО РАН
author_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ НАУЧНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР ИНСТИТУТ ЦИТОЛОГИИ И ГЕНЕТИКИ СИБИРСКОГО ОТДЕЛЕНИЯ  РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК"
author_organization.ogrn: 1025403657410
author_organization.supervisor_name: АЛЕКСЕЙ
author_organization.supervisor_surname: КОЧЕТОВ
author_organization.supervisor_patronymic: ВЛАДИМИРОВИЧ
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения