name: Молекулярные механизмы ответа растений льна обыкновенного (Linum usitatissimum L.) на заражение грибом Fusarium oxysporum f. sp. lini
keyword_list: Linum usitatissimum Гриб Лён Транскриптом Геном Fusarium oxysporum f. sp. lini
abstract: Впервые проведено секвенирование генома патогена льна F. oxysporum f. sp. lini. Получены геномные сборки 6 штаммов высокой, средней и низкой степени вирулентности по отношению к L. usitatissimum. При сравнении полученных геномных сборок установлено значительное различие между ними по длине. Выявлена более высокая гомология при сравнении геномов штаммов F. oxysporum f. sp. lini между собой, чем при их сравнении с геномами других форм F. oxysporum. Установлено различие между исследуемыми штаммами по числу копий генов SIX (Secreted in xylem), ассоциированных с вирулентностью F. oxysporum. Их насчитывалось у каждого штамма от 10 до 12 за исключением штамма 482, где гены SIX обнаружены не были. Показана кластеризация генов SIX в геномах исследуемых штаммов. Полученные геномные сборки F. oxysporum f. sp. lini и результаты их сравнительного анализа являются основой для установления механизмов вирулентности гриба и устойчивости растений льна к нему.
  Впервые получены данные секвенирования транскриптомов 12 сортов/линий льна, несущих различные гены устойчивости Fu (Fu 4, Fu 5, Fu 6, Fu 7, Fu 8, Fu 9, Fu 10, Fu 11), и 2 восприимчивых сортов/линий в контрольных условиях и при заражении F. oxysporum f. sp. lini. Это позволило провести сравнительный анализ экспрессии генов между восемью группами генотипов льна, в каждой из которых представлен один из восьми исследуемых генов устойчивости, и группой восприимчивых сортов/линий в контрольных условиях и при заражении грибом. Идентифицированы гены с повышенной экспрессией в группах устойчивых сортов/линий льна при заражении грибом по сравнению с контрольными условиями и повышенной экспрессией в тех же группах устойчивых сортов/линий по сравнению с восприимчивыми при заражении. Некоторые из этих генов встречались сразу в нескольких группах устойчивых генотипов, они, вероятно, связаны с общими механизмами устойчивости льна к F. oxysporum f. sp. lini, но были и те, что встречались только в одной из групп и, возможно, среди них присутствуют и так называемые R-гены (гены устойчивости), определяющие устойчивость растений льна к F. oxysporum f. sp. lini. Полученные результаты расширяют представление о молекулярных механизмах устойчивости L. usitatissimum к F. oxysporum f. sp. lini и являются основой для селекции сортов льна, устойчивых к данному патогену.
chairman_dissertation_council.name: Сергей
chairman_dissertation_council.surname: Кочетков
chairman_dissertation_council.patronymic: Николаевич
chairman_dissertation_council.position: главный научный сотрудник
chairman_dissertation_council.degree: Доктор химических наук
chairman_dissertation_council.rank: Академик
chairman_dissertation_council.wos_research_id: O-1065-2013
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 7006711268
chairman_dissertation_council.rinc_id: 820
chairman_dissertation_council.orcid: 0000-0002-7443-6961
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: София
organization_supervisor.surname: Георгиева
organization_supervisor.patronymic: Георгиевна
organization_supervisor.position: директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.31.35
rubrics.name: Патофизиология растений
rubrics.code: 34.15.61
rubrics.name: Молекулярные критерии адаптации
oecds.code: 01.06.CQ
oecds.name: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
speciality_codes.name: Молекулярная биология
speciality_codes.code: 1.5.3.
supervisors.fio: Дмитриев А.А.
supervisors.scientific_degree: Кандидат биологических наук
supervisors.speciality_code: Молекулярная биология
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Калашникова Е.А.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Биотехнология (в том числе бионанотехнологии)
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИМБ РАН
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук
protection_organization.ogrn: 1037736018066
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ИМБ РАН
author_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук
author_organization.ogrn: 1037736018066
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения