name: ТАКСОНОМИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ КИШЕЧНОЙ МИКРОБИОТЫ И ЕГО КЛИНИЧЕСКОЕ ЗНАЧЕНИЕ В РАЗВИТИИ ПАТОЛОГИИ ПИЩЕВАРИТЕЛЬНОГО ТРАКТА НА ФОНЕ ИНВАЗИИ 
  OPISTHORCHIS FELINEUS У ДЕТЕЙ
keyword_list: микробиота
abstract: В результате исследования впервые за последние 10 лет актуализированы данные о распространенности и интенсивности инвазии O. felineus у детей с использованием фундаментальных эпидемиологических подходов и современных паразитологических методов (микроскопия образцов стула с использованием концентраторов «PARASEP»). В рамках исследования впервые выполнено комплексное обследование детей и подростков, проживающих в эндемичном регионе. Установлено, что инвазия O. felineus ассоциирована с изменениями желчного пузыря в виде утолщения и неровности стенки, наличия эхогенного содержимого (OR = 1,9; 95 % CI 1,2–3,1; p = 0,012) и признаками перидуктального фиброза первой степени (OR = 3,1; 95 % CI 1,0–9,7; p = 0,04) по данным ультразвукового исследования.
  Впервые в результате исследования с использованием технологии секвенирования по фрагменту V4 гена бактериальной 16S рРНК получены данные о составе микробиоты кишечника у детей, страдающих инвазией O. felineus, а также после антигельминтной терапии. Новыми являются данные о том, что микробиота кишечника у детей, страдающих инвазией O. felineus, до и после антигельминтной терапии, характеризуется столь же разнообразным таксономическим составом, что и микробиота детей без инвазии. Однако, выявлена положительная связь между интенсивностью инвазии O. felineus, измеряемой как количество яиц гельминта в одном грамме стула, и α-разнообразием кишечной микробиоты. При оценке β-разнообразия микробиоты выявлены различия между составом метагенома пациентов, страдающих инвазией O. felineus, и неинвазированных детей (R2 = 0,05; p = 0,01), а также между образцами, полученными после дегельминтизации празиквантелом, и детей, не имеющих инвазии (R2 = 0,07; р < 0,01). Получены новые данные об ассоциации инвазии O. felineus у детей с изменениями количественной представленности ряда микроорганизмов на разных таксономических уровнях, при этом изменения зависят от интенсивности инвазии и клинической формы описторхоза.
  Приоритетными стали данные о вкладе микробиоты кишечника на фоне описторхоза у детей в развитие патологии пищеварительного тракта. Микробиота при инвазии O. felineus характеризуется увеличением представленности потенциально патогенных микроорганизмов (Proteobacteria, Enterobacteriaceae, Escherichia-Shigella) и снижением представленности комменсальных бактерий Firmicutes. Антигельминтная терапия приводит к изменению представленности микроорганизмов Firmicutes и Proteobacteria, а также представленности бутират-продуцирующих (увеличение Faecalibacterium, снижение Roseburia) и условно-патогенных бактерий (снижение Synergistetes и Escherichia-Shigella, Howardella, Slackia, повышение Leuconostoc, Varibaculum). 
  Сформирована база данных, содержащая метагеномные данные о составе микробиоты кишечника у детей в зависимости от наличия инвазии O. felineus в эндемичном регионе (DOI:10.5281/zenodo.4304728).
chairman_dissertation_council.name: Вадим
chairman_dissertation_council.surname: Калюжин
chairman_dissertation_council.patronymic: Витальевич
chairman_dissertation_council.position: зав.кафедрой
chairman_dissertation_council.degree: Доктор медицинских наук
chairman_dissertation_council.rank: Профессор
chairman_dissertation_council.wos_research_id: H-7955-2014
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 6603397191
chairman_dissertation_council.rinc_id: 98122
chairman_dissertation_council.url: https://ssmu.ru/ru/obrazovanie/departments/goster/kalyujin/
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Евгений
organization_supervisor.surname: Куликов
organization_supervisor.patronymic: Сергеевич
organization_supervisor.position: и.о. ректора
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 76.29.47
rubrics.name: Педиатрия
oecds.code: 03.02.TQ
oecds.name: PEDIATRICS
speciality_codes.name: Педиатрия
speciality_codes.code: 14.01.08
supervisors.fio: Федорова О.С.
supervisors.scientific_degree: Доктор медицинских наук
supervisors.speciality_code: Педиатрия
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Рычкова Л.В.
opponents.scientific_degree: Доктор медицинских наук
opponents.speciality_code: Педиатрия
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Усенко Д.С.
opponents.scientific_degree: Доктор медицинских наук
opponents.speciality_code: Инфекционные болезни
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ФГБОУ ВО СИБГМУ МИНЗДРАВА РОССИИ
protection_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "СИБИРСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ" МИНИСТЕРСТВА ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
protection_organization.ogrn: 1027000885251
protection_organization.supervisor_name: ЕВГЕНИЙ
protection_organization.supervisor_surname: КУЛИКОВ
protection_organization.supervisor_patronymic: СЕРГЕЕВИЧ
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство здравоохранения Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ФГБОУ ВО СИБГМУ МИНЗДРАВА РОССИИ
author_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "СИБИРСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ" МИНИСТЕРСТВА ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
author_organization.ogrn: 1027000885251
author_organization.supervisor_name: ЕВГЕНИЙ
author_organization.supervisor_surname: КУЛИКОВ
author_organization.supervisor_patronymic: СЕРГЕЕВИЧ
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство здравоохранения Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения