name: Механизмы регуляции дистанционных взаимодействий между энхансерами и промоторами в комплексе Bithorax Drosophila melanogaster
keyword_list: Bithorax  комплекс инсуляторы энхансеры промоторы
abstract: В работе проведено комплексное исследование структуры и свойств границ, имеющих характерные свойства инсуляторов, которые разделяют регуляторную область гена Abd-B комплекса Bithorax на отдельные независимые домены. C этой целью были использованы модельные системы в трансгенных линиях дрозофилы и современные методы редактирования генома in vivo. В результате впервые в трансгенных модельных системах дрозофилы показано, что границы регуляторной области Abd-B взаимодействуют между собой и областью перед промотором Abd-B. Впервые показано, что взаимная ориентация взаимодействующих границ/инсуляторов влияет на архитектуру хроматиновой петли и, как следствие, на взаимодействие между энхансером и промотором, расположенными вблизи инсуляторов. Показано, что две копии одного инсулятора (Мср, Fab-7) могут поддерживать сверхдальние взаимодействия в геноме. На основе этих результатов разработана модель формирования дистанционных взаимодействий в ядре, согласно которой, каждая граница состоит из сайтов связывания для нескольких архитектурных/инсуляторных белков, которые гомодимеризуются, что поддерживает формирование хроматиновой петли определённой конфигурации. Также сформулирована новая модель регуляции транскрипции гена Abd-B, согласно которой границы доменов регуляторной области не только изолируют соседние домены, но и обеспечивают правильный контакт энхансеров домена с промотором в нужном сегменте. Впервые данная модель подтверждена прямыми экспериментами по замене границ непосредственно в BX-C. В составе границ Fab-7 и Fab-8 картированы участки, которые необходимы для организации специфичных дистанционных взаимодействий между iab-энхансерами и промотором Abd-B. Также найдены участки границ, которые обеспечивают функциональную автономность iab-доменов. Впервые обнаружено, что в барьерной функции границы Fab-7 участвует PRE, который привлекает белки группы Polycomb и является сайленсером. В составе границы Fab-7 идентифицированы два сайта белка Pita, которые являются избыточными для функциональной активности границы. Показано, что Mcp содержит по одному сайту связывания белков dCTCF и Pita, кооперация которых необходима для функциональной активности границы.
chairman_dissertation_council.name: Георгий
chairman_dissertation_council.surname: Георгиев
chairman_dissertation_council.patronymic: Павлович
chairman_dissertation_council.position: главный научный сотрудник
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
chairman_dissertation_council.rank: Академик
chairman_dissertation_council.wos_research_id: 0
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 35600686700
chairman_dissertation_council.rinc_id: 84954
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Павел
organization_supervisor.surname: Георгиев
organization_supervisor.patronymic: Георгиевич
organization_supervisor.position: директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.15.27
rubrics.name: Генетическая инженерия
rubrics.code: 34.15.25
rubrics.name: Молекулярная биология гена
rubrics.code: 34.15.23
rubrics.name: Молекулярная генетика
oecds.code: 01.06.CQ
oecds.name: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
speciality_codes.name: Молекулярная биология
speciality_codes.code: 03.01.03
supervisors.fio: Георгиев П.Г.
supervisors.scientific_degree: Доктор биологических наук
supervisors.speciality_code: Молекулярная генетика
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Демаков С.А.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Генетика
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Калмыкова А.И.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Молекулярная генетика
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Зацепина О.Г.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Молекулярная биология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИБГ РАН
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биологии гена Российской академии наук
protection_organization.ogrn: 1027739618037
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Учреждения
author_organization.short_name: ИБГ РАН
author_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биологии гена Российской академии наук
author_organization.ogrn: 1027739618037
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Учреждения