name: Разработка методов автоматического определения количественных характеристик, описывающих фенотипические признаки колоса пшеницы
keyword_list: Пшеница колос фенотипирование мобильное приложение анализ изображений
abstract: Целью работы была разработка методов автоматического определения количественных морфометрических характеристик колосьев и зерен пшеницы на основе анализа их цифровых изображений. Работа основывается на методах компьютерного зрения, машинного обучения, статистического анализа. Используемая аппаратура включала: микроскоп, мобильные устройства, студийное фотооборудование. В результате были разработаны: мобильное приложение SeedCounter для подсчета зерен пшеницы и определения их размеров; метод морфометрии колосьев пшеницы, реализованный в виде приложения WERecongizer; компьютерная система SpikeDroid, для систематизации и хранения полученных данных. С помощью предложенных методов проведен анализ формы колосьев 14 генотипов пяти видов гексаплоидных пшениц. Разработанная система SpikeDroid позволяет существенно ускорить процесс массового фенотипирования благодаря автоматизации этапов начиная от получения изображений, заканчивая статистическим анализом занесенных в базу данных параметров. Разработанные методы используются в селекционных исследованиях сторонних научных групп, что подтверждено научными публикациями со ссылками на опубликованные автором статьи.
chairman_dissertation_council.name: Владимир
chairman_dissertation_council.surname: Шумный
chairman_dissertation_council.patronymic: Константинович
chairman_dissertation_council.position: Председатель
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
chairman_dissertation_council.rank: Академик
chairman_dissertation_council.wos_research_id: -
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 6603898963
chairman_dissertation_council.rinc_id: 8554
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Алексей
organization_supervisor.surname: Кочетов
organization_supervisor.patronymic: Владимирович
organization_supervisor.position: директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.03.23
rubrics.name: Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
rubrics.code: 20.53.17
rubrics.name: Средства хранения информации
rubrics.code: 34.05.25
rubrics.name: Методы и аппаратура для регистрации, обработки и хранения биологических данных
oecds.code: 01.02.ET
oecds.name: COMPUTER SCIENCE, INFORMATION SYSTEMS
oecds.code: 01.06.MC
oecds.name: MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
oecds.code: 01.06.DE
oecds.name: PLANT SCIENCES
speciality_codes.name: Математическая биология, биоинформатика
speciality_codes.code: 03.01.09
supervisors.fio: Афонников Д.А.
supervisors.scientific_degree: Кандидат биологических наук
supervisors.speciality_code: Математическая биология, биоинформатика
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Ратушняк А.С.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Физиология
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Козлов К.Н.
opponents.scientific_degree: Кандидат биологических наук
opponents.speciality_code: Математическая биология, биоинформатика
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИЦИГ СО РАН
protection_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ НАУЧНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР ИНСТИТУТ ЦИТОЛОГИИ И ГЕНЕТИКИ СИБИРСКОГО ОТДЕЛЕНИЯ  РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК"
protection_organization.ogrn: 1025403657410
protection_organization.supervisor_name: АЛЕКСЕЙ
protection_organization.supervisor_surname: КОЧЕТОВ
protection_organization.supervisor_patronymic: ВЛАДИМИРОВИЧ
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ИЦИГ СО РАН
author_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ НАУЧНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР ИНСТИТУТ ЦИТОЛОГИИ И ГЕНЕТИКИ СИБИРСКОГО ОТДЕЛЕНИЯ  РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК"
author_organization.ogrn: 1025403657410
author_organization.supervisor_name: АЛЕКСЕЙ
author_organization.supervisor_surname: КОЧЕТОВ
author_organization.supervisor_patronymic: ВЛАДИМИРОВИЧ
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения