name: Новые моно- и бифункциональные конструкции на основе 2'-F-модифицированных РНК-аптамеров для детекции гемоглобина человека
keyword_list: РНК-апрамеры детекция гемоглобина
abstract: В рамках данной работы была исследована возможность создания новых систем детекции на основе аптамеров для количественного определения белковых биомаркеров на примере суммарного и гликированного гемоглобинов. Гликированный гемоглобин HbA1c является одним из основных биомаркеров сахарного диабета. Его относительное содержание в суммарном гемоглобине крови позволяет оценить средний уровень гликемии за прошедшие 6-8 недель и может быть использовано для ранней диагностики заболевания. В текущей клинической практике для определения уровня гликированного гемоглобина используют аффинную хроматографию, иммуноферментный анализ и массспектрометрию, однако каждый из этих методов имеет определенные недостатки
  Целью данной работы является получение новых моно- и бифункциональных конструкций на основе 2'-F—пиримидинмодифицированных РНК-аптамеров и исследование возможности создания на их основе систем для оптической детекции белковых биомаркеров на примере суммарного и гликированного гемоглобинов
  В
  рамках данной диссертационной работы впервые получены 2'-F-РНК аптамеры, способные связывать суммарный и гликированный гемоглобин человека. Проведена оптимизация их нуклеотидной последовательности, с использованием комплекса биофизических методов анализа показано формирование квадруплексных структур в составе G-богатых аптамеров. Сконструирована система гетерофазной колориметрической детекции гемоглобина с помощью полученных аптамеров с прямой иммобилизацией аналита, а также в сэндвичформате в сочетании с гемоглобин-специфичными поликлональными антителами. Разработана система биолюминесцентной детекции гемоглобина в гетерофазном варианте с использованием конъюгатов Ca2+ зависимого фотопротеина обелина с антителами. Показана принципиальная возможность селективной биолюминесцентной детекции гликированного гемоглобина в присутствии суммарного гемоглобина. Предложена новая стратегия создания систем для биолюминесцентной детекции с нековалентной иммобилизацией фотопротеина обелина через специфичный к нему аптамер. Впервые получены 2'-F-РНК аптамеры, узнающие фотопротеин обелин, проведена оптимизация их нуклеотидной последовательности с сохранением аффинности к белковой мишени. Создана серия бифункциональных аптамеров с переключаемой активностью, состоящих из гемоглобин-связывающего и обелин-связывающего модулей. Показана принципиальная возможность биолюминесцентной детекции суммарного гемоглобина в растворе с использованием бифункциональных конструкций. Полученные данные позволяют рассматривать предложенный подход к конструированию аптасенсоров в качестве принципиально нового метода детекции белковых биомаркеров.
chairman_dissertation_council.name: Дмитрий
chairman_dissertation_council.surname: Пышный
chairman_dissertation_council.patronymic: Владимирович
chairman_dissertation_council.position: директор
chairman_dissertation_council.degree: Доктор химических наук
chairman_dissertation_council.rank: Член-корреспондент РАН
chairman_dissertation_council.wos_research_id: F-4729-2013
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 7006677629
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Дмитрий
organization_supervisor.surname: Пышный
organization_supervisor.patronymic: Владимирович
organization_supervisor.position: директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.15.17
rubrics.name: Макромолекулярные ассоциации и проблемы узнавания в молекулярной биологии
rubrics.code: 31.23.29
rubrics.name: Нуклеиновые кислоты и их компоненты
rubrics.code: 31.27.15
rubrics.name: Структура и функции биополимеров
oecds.code: 01.06.CO
oecds.name: BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS
oecds.code: 01.06.CQ
oecds.name: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
speciality_codes.name: Биоорганическая химия
speciality_codes.code: 02.00.10
supervisors.fio: Воробьева М. А.
supervisors.scientific_degree: Кандидат химических наук
supervisors.speciality_code: Биоорганическая химия
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Копылов А. М.
opponents.scientific_degree: Доктор химических наук
opponents.speciality_code: Биоорганическая химия
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Шестопалов  А. М.
opponents.scientific_degree: Доктор химических наук
opponents.speciality_code: Неорганическая химия
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Жарков Д. О.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Биохимия
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИХБФМ СО РАН
protection_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ ИНСТИТУТ ХИМИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ И ФУНДАМЕНТАЛЬНОЙ МЕДИЦИНЫ СИБИРСКОГО ОТДЕЛЕНИЯ РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК
protection_organization.ogrn: 1025403659852
protection_organization.supervisor_name: ДМИТРИЙ
protection_organization.supervisor_surname: ПЫШНЫЙ
protection_organization.supervisor_patronymic: ВЛАДИМИРОВИЧ
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ИХБФМ СО РАН
author_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ ИНСТИТУТ ХИМИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ И ФУНДАМЕНТАЛЬНОЙ МЕДИЦИНЫ СИБИРСКОГО ОТДЕЛЕНИЯ РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК
author_organization.ogrn: 1025403659852
author_organization.supervisor_name: ДМИТРИЙ
author_organization.supervisor_surname: ПЫШНЫЙ
author_organization.supervisor_patronymic: ВЛАДИМИРОВИЧ
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения