name: Роль белков hnRNP-K и Pcbp1 в плюрипотентных стволовых клетках мыши
keyword_list: ПЛЮРИПОТЕНТНОСТЬ, ПОЛИЦ-СВЯЗЫВАЮЩИЕ БЕЛКИ, ХРОМАТИН, НАИВНАЯ ПЛЮРИПОТЕНТНОСТЬ, ПРАЙМИРОВАННАЯ ПЛЮРИПОТЕНТНОСТЬ, ДИФФЕРЕНЦИРОВКА.
abstract: Цель: выявление функций KH-доменных белков hnRNP K и Pcbp1 в плюрипотентных стволовых клетках мыши. Методом ChIP-seq показано, что оба белка связывают в ЭСК мыши сайты 2А и 1А дистального и проксимального энхансеров гена Pou5f1 (Oct4) соответственно. В ходе генных нокдауна и нокаута выяснилось, что сами по себе hnRNP-K и Pcbp1 не участвуют в регуляции экспрессии Oct4. HnRNP-K оказался необходим для поддержания жизнеспособности и плюрипотентных, и дифференцированных клеток. Дальнейший анализ ChIP-seq-данных показал, что в геноме ЭСК hnRNP-K локализован исключительно в транскрипционно активном и открытом хроматине. Выявлено, что Pcbp1 не нужен для поддержания плюрипотентности ЭСК и ЭпиСК, находящихся в состоянии наивной и праймированной плюрипотентности, однако необходим при переходе между этими состояниями, так как координирует программу экспрессии генов примитивной энтодермы и поддерживает жизнеспособность клеток.
chairman_dissertation_council.surname: Корнилова Е.С.
chairman_dissertation_council.position: заведующая лабораторией
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
organization_supervisor.surname: Томилин А. Н.
organization_supervisor.position: ВРИО директора
organization_supervisor.degree: Доктор биологических наук
rubrics.code: 34.15.49
rubrics.name: Молекулярная биология развития и старения
oecds.code: 01.06.CU
oecds.name: BIOLOGY
speciality_codes.name: Молекулярная биология
speciality_codes.code: 03.01.03
supervisors.fio: Томилин А.Н.
supervisors.scientific_degree: Доктор биологических наук
supervisors.speciality_code: Клеточная биология, цитология, гистология
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Лагарькова М.А.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Генетика
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Орлов С.В.
opponents.scientific_degree: Кандидат биологических наук
opponents.speciality_code: Биохимия
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИНЦ РАН
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт цитологии Российской академии наук
protection_organization.ogrn: 1027801540964
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ИНЦ РАН
author_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт цитологии Российской академии наук
author_organization.ogrn: 1027801540964
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения