name: Исследование процессов разворачивания и сворачивания in vitro молекулярных шаперонов GroEL и GroES клеток Escherichia coli
keyword_list: GroES GroEL, молекулярные шапероны, сворачивание белков, самоорганизация олигомерных структур,
abstract: Работа посвящена исследованию in vitro процессов самоорганизации молекулярных шаперонов GroEL и GroES, участвующих в фолдинге многих глобулярных белков и обеспечивающих функционирование клеток. Использование традиционных методов биохимии и биофизики, а также разработка на основе электронной микроскопии нового способа визуализации продуктов сборки олигомерных белков позволили детально охарактеризовать равновесное и кинетическое сворачивание субъединиц и формирование четвертичной структуры молекулярных шаперонов.
  Впервые выявлено промежуточное, критичное для сборки шаперонов, гептамерное состояние GroEL, а также определены времена образования субъединиц и их сборки в олигомерную систему. Полученные результаты позволили предложить модель сборки комплекса GroEL/ES in vitro, раскрывающую этапы этого процесса и способствующую его пониманию in vivo. Показано, ко-шаперон GroES взаимодействует с промежуточным гептамером GroEL, стабилизируя структуру последнего, и обеспечивает сборку нативной GroEL-частицы. Работа вносит существенный вклад в понимание процесса фолдинга олигомерных белков и в решение глобальной проблемы формирования полипептидной цепью нативной структуры. Понимание механизма сворачивания шаперонов имеет не только фундаментальное значение, но также имеет важный практический аспект, позволяя создавать искусственные белковые конструкции с заданными шаперонными свойствами для нужд биотехнологии. 
  Работа выполнена в ФГБУН Институте белка РАН  при непосредственном участии соискателя в планировании и проведении научных экспериментов, обработке и интерпретации полученных данных, подготовке основных научных публикаций и представлении результатов на научных конференциях. Научным руководителем работы является д.ф.-м.н., проф. Семисотнов Геннадий Васильевич, руководитель группы экспериментальных исследований и инженерии олигомерных структур  ИБ РАН.
  Ведущая организация - ФГБУН Институт биоорганической химии им. академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН, г. Москва. Официальные оппоненты: Тимченко Мария Александровна, к.б.н., с.н.с.  ФГБУН Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН, Федоров Алексей Николаевич, д.б.н., директор ФГУ «Федеральный исследовательский центр «Фундаментальные основы биотехнологии» Российской академии наук». Основные научные результаты работы отражены в публикациях: Ryabova N. A., Marchenkov V. V., Marchenkova S. Yu., Kotova N. V., Semisotnov G. V. Molecular Chaperone GroEL/ES: Unfolding and Refolding Processes // Biochemistry (Moscow). – 2013. – V. 78 (13). – P. 1405-1414; Ryabova N., Marchenkov V., Kotova N., Semisotnov G. Chaperonin GroEL Reassembly: An Effect of Protein Ligands and Solvent Composition // Biomolecules. – 2014. – V.4. – P.458-473; Рябова Н.А., Селиванова О.М., Семисотнов Г.В. Лиганд-индуцируемая сборка шаперона GroEL/ES in vitro: визуализация электронной микроскопией // Молекулярная биология. – 2018. – Т. 52 (1). – С. 120-124.
chairman_dissertation_council.name: Евгений
chairman_dissertation_council.surname: Фесенко
chairman_dissertation_council.patronymic: Евгеньевич
chairman_dissertation_council.position: заведующий лабораторией
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
chairman_dissertation_council.rank: Член-корреспондент РАН
chairman_dissertation_council.wos_research_id: С-7437-2015
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 7101769087
chairman_dissertation_council.rinc_id: 78364
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Павел
organization_supervisor.surname: Грабарник
organization_supervisor.patronymic: Яковлевич
organization_supervisor.position: директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.15.17
rubrics.name: Макромолекулярные ассоциации и проблемы узнавания в молекулярной биологии
oecds.code: 01.06.CQ
oecds.name: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
speciality_codes.name: Молекулярная биология
speciality_codes.code: 03.01.03
supervisors.fio: Семисотнов  Г.В.
supervisors.scientific_degree: Доктор физико-математических наук
supervisors.speciality_code: Биофизика
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Федоров А.Н.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Биохимия
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Тимченко М.А.
opponents.scientific_degree: Кандидат биологических наук
opponents.speciality_code: Молекулярная биология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ФИЦ ПНЦБИ РАН
protection_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР "ПУЩИНСКИЙ НАУЧНЫЙ ЦЕНТР БИОЛОГИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК"
protection_organization.ogrn: 1025007768983
protection_organization.supervisor_name: ПАВЕЛ
protection_organization.supervisor_surname: ГРАБАРНИК
protection_organization.supervisor_patronymic: ЯКОВЛЕВИЧ
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ИБ РАН
author_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт белка Российской академии наук
author_organization.ogrn: 1025007773262
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения