name: Подходы к повышению эффективности гомологичной репарации при геномном редактировании
keyword_list: NUDT16L1 MAD2L2 CRISPR-Cas9 направленная гомологичная репарация негомологичное соединение концов SCAI
abstract: В диссертационной работе разработаны подходы для повышения эффективности редактирования генома с помощью воздействия на факторы репарации двунитевых разрывов ДНК. Методики включали в себя нокдаун гена MAD2L2, нокдаун и гиперэкспрессию гена NUDT16L1, а также использование слитого белка Cas9-SCAI. В ходе работы использован широкий спектр молекулярно-биологических методов и методов работы с эукариотическими клеточными культурами, что позволило протестировать разработанные подходы на клеточной культуре HEK293T в геномном и в плазмидном локусе EGFPmut. Показано, что нокдаун факторов MAD2L2 и NUDT16L1 вызвает повышение уровня направленной гомологичной репарации, выраженное в увеличении доли  GFP-позитивных клеток в 2,0-10,2 раз и доли отредактированных аллелей в 1,8-3,7 раз. Выявлено, что гиперкспрессия NUDT16L1 и использование слитого белка Cas9-SCAI снижает эффективность гомологичной репарации в – 2,5 раза. Кроме того, обнаружено, что воздействие неспецифических миРНК вызывает повышение экспрессии гена NUDT16L1 на уровне мРНК в 1,2 – 1,7 раз
chairman_dissertation_council.name: Евгений
chairman_dissertation_council.surname: Гинтер
chairman_dissertation_council.patronymic: Константинович
chairman_dissertation_council.position: научный руководитель центра
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
chairman_dissertation_council.rank: Академик
chairman_dissertation_council.wos_research_id: B-2287-2016
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 7103183365
chairman_dissertation_council.rinc_id: 755
chairman_dissertation_council.orcid: 0000-0001-6920-6726
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Сергей
organization_supervisor.surname: Куцев
organization_supervisor.patronymic: Иванович
organization_supervisor.position: директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.23.17
rubrics.name: Биохимическая генетика
rubrics.code: 34.23.23
rubrics.name: Цитогенетика
rubrics.code: 76.03.39
rubrics.name: Медицинская генетика. Медико-генетическое консультирование
oecds.code: 01.06.KM
oecds.name: GENETICS & HEREDITY
speciality_codes.name: Генетика
speciality_codes.code: 03.02.07
supervisors.fio: Лавров А.В.
supervisors.scientific_degree: Кандидат медицинских наук
supervisors.speciality_code: Генетика
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Ким А.И.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Генетика
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Жарков Д.О.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Биохимия
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ФГБНУ «МГНЦ»
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова»
protection_organization.ogrn: 1027739609480
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ФГБНУ «МГНЦ»
author_organization.name: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова»
author_organization.ogrn: 1027739609480
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения