name: РАЗРАБОТКА ВЫЧИСЛИТЕЛЬНЫХ МЕТОДОВ ДЛЯ АНАЛИЗА И ВИЗУАЛИЗАЦИИ ЭУКАРИОТИЧЕСКИХ ГЕНОМНЫХ СБОРОК
keyword_list: геном человека тандемные повторы сборка генома секвенирование геномика Биоинформатика
abstract: Актуальность темы исследования. Оценка качества и поиск ошибок сборки являются неотъемлемым этапом любого геномного проекта. Стремительное развитие технологий секвенирования генома и алгоритмов сборки генома в последние годы привело к появлению огромного количества качественных сборок геномов эукариотических организмов. Соответственно, данное исследование было направлено на разработку высокопроизводительных методов и алгоритмов для анализа новых геномных сборок. Научная новизна. В представленной диссертации представлены новые вычислительные методы оценки качества геномных сборок, разработанные с учетом особенностей эукариотических геномов. Впервые предложены методы для всестороннего анализа сборок длинных тандемных повторов, позволяющие детектировать ошибки сборки, и показано их применение для новых сборок центромерных регионов генома человека. Представлены новые подходы к визуализации геномных сборок и графов сборки
chairman_dissertation_council.name: Ольга
chairman_dissertation_council.surname: Подгорная
chairman_dissertation_council.patronymic: Игоревна
chairman_dissertation_council.position: профессор Кафедры цитологии и гистологии
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
chairman_dissertation_council.rank: Профессор
chairman_dissertation_council.wos_research_id: E-4325-2013
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 7003705684
chairman_dissertation_council.rinc_id: 78695
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Александр
organization_supervisor.surname: Гнетов
organization_supervisor.patronymic: Валентинович
organization_supervisor.position: Ученый секретарь СПбГУ
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.03.23
rubrics.name: Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
oecds.code: 01.06.MC
oecds.name: MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
speciality_codes.name: Математическая биология, биоинформатика
speciality_codes.code: 03.01.09
supervisors.fio: Певзнер П.А.
supervisors.scientific_degree: Кандидат физико-математических наук
supervisors.speciality_code: Математическая биология, биоинформатика
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
protection_organization.short_name: Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербургский университет, СПбГУ
protection_organization.name: федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский государственный университет"
protection_organization.ogrn: 1037800006089
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Правительство Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербургский университет, СПбГУ
author_organization.name: федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский государственный университет"
author_organization.ogrn: 1037800006089
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Правительство Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения