name: Молекулярно-динамическое моделирование реакций в гидратированных системах
keyword_list: молекулярная динамика молекулярная динамика Борна-Оппенгеймера КМ/ММ МД таутомерные равновесия расчет энергии Гиббса моделирование спектров поглощения каликс-[4]-арен электростатический потенциал растворителя ДМГИ
abstract: В работе рассматриваются реакции в гидратированных системах: первая стадия ферментативного катализа в матриксной металлопротеиназе-2, образование комплексов каликс-[4]-арена с катионами натрия и цезия и таутомерные переходы в нейтральных водных растворах 4,5-диметил-2-(2’-гидроксифенил)имидазола (ДМГИ). Использование сольватной оболочки соизмеримой и покрывающей фермент-субстратный комплекс достаточно для воспроизведения усредненного электростатического потенциала, создаваемого молекулами растворителя. Расчет профилей энергии Гиббса диссоциации комплексов каликс­-[4]-­арена с ионами цезия и натрия показал, что константа диссоциации комплекса каликс-­[4]-­арена с катионом цезия в 5×10^4 раз меньше, чем с катионом натрия. В нейтральном водном растворе ДМГИ в основном представлены кето и цис-­енольный таутомер, а также катионная форма в соотношении 6: 1: 1. Транс-­енольная форма отсутствует. Полоса поглощения в более длинноволновой области электронного спектра поглощения ДМГИ в нейтральном водном растворе принадлежит кето-­форме, а полоса в более коротковолновой области – цис-­енольной форме.
chairman_dissertation_council.name: Алексей
chairman_dissertation_council.surname: Горюнков
chairman_dissertation_council.patronymic: Анатольевич
chairman_dissertation_council.position: заведующий кафедрой
chairman_dissertation_council.degree: Доктор химических наук
chairman_dissertation_council.rank: Доцент
chairman_dissertation_council.wos_research_id: K-7653-2014
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 7801319320
chairman_dissertation_council.rinc_id: 120561
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Степан
organization_supervisor.surname: Калмыков
organization_supervisor.patronymic: Николаевич
organization_supervisor.position: декан
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 31.15.15
rubrics.name: Исследования строения и свойств молекул и химической связи
oecds.code: 01.04.EI
oecds.name: CHEMISTRY, PHYSICAL
speciality_codes.name: Физическая химия
speciality_codes.code: 1.4.4.
supervisors.fio: Хренова М.Г.
supervisors.scientific_degree: Доктор физико-математических наук
supervisors.speciality_code: Математическая и квантовая химия
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Крупянский Ю.Ф.
opponents.scientific_degree: Доктор физико-математических наук
opponents.speciality_code: Химическая физика, горение и взрыв, физика экстремальных состояний вещества
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Шайтан А.К.
opponents.scientific_degree: Доктор физико-математических наук
opponents.speciality_code: Математическая биология, биоинформатика
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Полынская Ю.Г.
opponents.scientific_degree: Кандидат физико-математических наук
opponents.speciality_code: Физическая химия
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ М.В.ЛОМОНОСОВА, МГУ ИМЕНИ М.В.ЛОМОНОСОВА, МОСКОВСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИЛИ МГУ
protection_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ М.В.ЛОМОНОСОВА"
protection_organization.ogrn: 1037700258694
protection_organization.supervisor_name: ВИКТОР
protection_organization.supervisor_surname: САДОВНИЧИЙ
protection_organization.supervisor_patronymic: АНТОНОВИЧ
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ М.В.ЛОМОНОСОВА, МГУ ИМЕНИ М.В.ЛОМОНОСОВА, МОСКОВСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИЛИ МГУ
author_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ М.В.ЛОМОНОСОВА"
author_organization.ogrn: 1037700258694
author_organization.supervisor_name: ВИКТОР
author_organization.supervisor_surname: САДОВНИЧИЙ
author_organization.supervisor_patronymic: АНТОНОВИЧ
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения