name: Детекция низкопредставленных белков 18 хромосомы методами таргетной протеомики
keyword_list: Масс-спектрометрия протеомика хромосомоцентричный проект протеома человека хроматография клеточная линия HepG2 двумерное фракционирование транскриптомика продукты генов 18 хромосомы человека
abstract: Протеом человека содержит огромное количество белков, в клетках и тканях организма они находятся в разной концентрации от 10-6 М до 10-18 М и ниже, что накладывает дополнительные ограничения и затрудняет их детекцию в низкой концентрации. Впервые разработан и применен метод таргетного протеомного анализа с применением двумерного фракционирования биологических образцов. Разработан новый подход, с помощью которого можно обнаружить белки, которые не детектируются при исследовании образцов методами стандартного таргетного и панорамного анализа. Используемый в работе подход универсален. Он может применяться к исследованию широкого ряда комплексных биологических образцов. Автор проводил поиск и анализ литературы, планирование экспериментов, пробоподготовку, масс-спектрометрический, хроматографический, а также биоинформатический анализ полученных данных и подготовку результатов работы к публикации. Применение методики двумерного фракционирования позволило увеличить количество идентификаций белков на 100% и на 33% для панорамного и таргетного анализа, соответственно. Методика обладает высокими показателями стабильности измерений, что позволило зарегистрировать 69 белков в каждом образце печени человека, в том числе 17 белков с концентрацией менее 1000 копий на клетку.
chairman_dissertation_council.name: Александр
chairman_dissertation_council.surname: Арчаков
chairman_dissertation_council.patronymic: Иванович
chairman_dissertation_council.position: Научный руководитель Института, гл. научн. сотр.
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
chairman_dissertation_council.rank: Академик
chairman_dissertation_council.wos_research_id: В-5194-2012
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 36049531500, 57202449291
chairman_dissertation_council.rinc_id: 78435
chairman_dissertation_council.orcid: -
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Елена
organization_supervisor.surname: Пономаренко
organization_supervisor.patronymic: Александровна
organization_supervisor.position: Директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.05.17
rubrics.name: Методы биологических исследований
rubrics.code: 34.15.15
rubrics.name: Пространственная структура и свойства биополимеров
oecds.code: 01.06.CQ
oecds.name: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
speciality_codes.name: Биохимия
speciality_codes.code: 1.5.4.
supervisors.fio: Згода В.Г.
supervisors.scientific_degree: Доктор биологических наук
supervisors.speciality_code: Биохимия
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Шевченко В.Е.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Онкология
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Лазарев В.Н.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Молекулярная биология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИБМХ
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича"
protection_organization.ogrn: 1027739053792
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ИБМХ
author_organization.name: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича"
author_organization.ogrn: 1027739053792
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения