name: Исследование механизма транс-сплайсинга у Drosophila melanogaster
keyword_list: АЛЬТЕРНАТИВНЫЙ СПЛАЙСИНГ, ТРАНС-СПЛАЙСИНГ, ИНТРОНЫ, ТРАНСКРИПЦИЯ, РЕГУЛЯЦИЯ ЭКСПРЕССИИ ГЕНОВ
abstract: Сплайсинг – это котранскрипционный процесс, необходимый для образования зрелой мРНК. Существуют два варианта сплайсинга: цис-сплайсинг и транс-сплайсинг. Цис-сплайсинг – это процесс, при котором происходит вырезание интронов из пре-мРНК и сшивание экзонов между собой. У некоторых эукариот, был обнаружен еще один вариант сплайсинга – межгенный транс-сплайсинг. При транс-сплайсинге происходит объединение экзонов, находящихся на разных пре-мРНК. В настоящее время единственные достоверные примеры такого варианта транс-сплайсинга были описаны в локусах mod(mdg4) и lola Drosophila melanogaster. Транс-сплайсинг в локусе mod(mdg4) происходит между 5"-транскриптом, который содержит четыре общих для всех изоформ экзона, и одним из альтернативных транскриптов, транскрибируемых с независимых промоторов, в том числе и находящихся в противоположной ориентации относительно основного транскрипта. Целью данной работы является идентификация регуляторных последовательностей в интроне 4, необходимых для осуществления транс-сплайсинга в локусе mod(mdg4) Drosophila melanogaster. Ключевой задачей для картирования ДНК последовательностей, участвующих в реализации транс-сплайсинга, являлось создание адекватной модельной системы. Созданная модельная система для оценки событий транс-сплайсинга позволяла детектировать транс-сплайсинг как на уровне белка, так и на уровне РНК. С помощью данной модельной системы была обнаружена 73-нуклеотидная последовательность, которая необходима для осуществления транс-сплайсинга в интроне 4 в локусе mod(mdg4) у Drosophila melanogaster. Также влияние найденной последовательности на эффективность транс-сплайсинга было проверено в эндогенном локусе mod(mdg4) с помощью направленного редактирования генома (CRISPR/Cas9). В интроне 4 был обнаружен промотор альтернативного экзона N и неканоническая терминация транскрипции, которая не связана с сигналом полиаденилирования. Был обнаружен участок из интрона 4, который осуществляет терминацию транскрипции не только в интроне 4 локуса mod(mdg4), но и в гетерологичной интроне.
chairman_dissertation_council.surname: Георгиев Г. П.
chairman_dissertation_council.position: г.н.с., советник РАН
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
organization_supervisor.surname: Георгиев П. Г.
organization_supervisor.position: директор
organization_supervisor.degree: Доктор биологических наук
rubrics.code: 34.15.25
rubrics.name: Молекулярная биология гена
rubrics.code: 34.15.23
rubrics.name: Молекулярная генетика
oecds.code: 01.06.KM
oecds.name: GENETICS & HEREDITY
oecds.code: 01.06.CQ
oecds.name: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
speciality_codes.name: Молекулярная генетика
speciality_codes.code: 03.01.07
supervisors.fio: Тихонов М.В.
supervisors.scientific_degree: Кандидат биологических наук
supervisors.speciality_code: Молекулярная генетика
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Буздин А.А.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Молекулярная биология
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Матюшенко А.М.
opponents.scientific_degree: Кандидат биологических наук
opponents.speciality_code: Биохимия
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИБГ РАН
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биологии гена Российской академии наук
protection_organization.ogrn: 1027739618037
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Учреждения
author_organization.short_name: ИБГ РАН
author_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биологии гена Российской академии наук
author_organization.ogrn: 1027739618037
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Учреждения