name: Эпидемиологические особенности тяжелых форм COVID-19
keyword_list: факторы риска, микробиом глотки, бактериальная суперинфекция, карбапенем-резистентные энтеробактерии, внутрибольничная инфекция, филогенетический анализ
abstract: Цель: Выявление эпидемиологических особенностей тяжелых форм COVID-19.
  Объект: заболеваемость новой коронавирусной инфекцией (СOVID-19), факторы риска развития тяжелого течения СOVID-19 и летального исхода у реанимационных больных.
  Методы: эпидемиологические, микробиологические, молекулярно-генетические, биоинформатические и статистические. Научная новизна: впервые выявлены особенности микробиома глотки пациентов с COVID-19, ассоциированные с риском госпитализации.  Доказано значение присоединения внутрибольничной бактериальной инфекции в качестве фактора риска развития летального исхода у госпитализированных пациентов с COVID-19. Впервые установлены закономерности распространения эпидемических клонов гипервирулентных и карбапенем-резистентных Klebsiella pneumoniae, мультиантибиотикорезистентных Acinetobacter baumannii в стационарах, перепрофилированных для лечения COVID-19. Теоритическая значимость. Дополнены существующие знания о факторах риска тяжелого течения инфекции, вызванной SARS-CoV-2, и, особенностях микробиома респираторного тракта, являющихся маркерами тяжелых форм COVID-19. Установлено, что в стационарах, которые оказывают помощь пациентам с данным заболеванием, наиболее распространены штаммы K. pneumoniae сиквенстипов, ассоциируемых с международными эпидемическими клонами (ST874, ST395, ST147, ST15, ST23, ST39, ST307), а также мультиантибиотикорезистентные штаммы A.baumannii, относящийся ко II международной пандемической линии.   Практическая значимость. На основе выявленных факторов риска (гипертоническая болезнь, ожирение, возраст пациентов старше 40 лет) разработана прогностическая модель по оценке вероятности развития тяжелых форм новой коронавирусной инфекции, позволяющая персонифицировать профилактические мероприятия. Разработан калькулятор риска развития тяжелых форм COVID-19.  Оценен риск развития летального исхода у реанимационных пациентов с COVID-19 при присоединении внутрибольничной бактериальной инфекции, что позволит скорректировать профилактические и противоэпидемические мероприятия, проводимые в стационаре. Разработаны мероприятия по совершенствованию системы микробиологического мониторинга в стационарах, оказывающих помощь пациентам с COVID-19.  Геномы восемнадцати карбапенем-резистентных штаммов K.pneumoniae и четырех мультиантибиотикорезистентные штаммов A.baumannii депонированы в GenBank в составе геномных проектов №PRJNA748260, №PRJNA788329, №PRJNA882742.
chairman_dissertation_council.name: Батырбек
chairman_dissertation_council.surname: Асланов
chairman_dissertation_council.patronymic: Исмелович
chairman_dissertation_council.position: Заведующий кафедрой
chairman_dissertation_council.degree: Доктор медицинских наук
chairman_dissertation_council.rank: Доцент
chairman_dissertation_council.wos_research_id: 0-9313-2014
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 6507783069
chairman_dissertation_council.rinc_id: 163778
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Сергей
organization_supervisor.surname: Сайганов
organization_supervisor.patronymic: Анатольевич
organization_supervisor.position: ректор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 76.33.43
rubrics.name: Эпидемиология
oecds.code: 03.03.HL
oecds.name: HEALTH CARE SCIENCES & SERVICES
speciality_codes.name: Эпидемиология
speciality_codes.code: 3.2.2.
supervisors.fio: гончаров артемий евгеньевич
supervisors.scientific_degree: Доктор медицинских наук
supervisors.speciality_code: Эпидемиология
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Углева Светлана Викторовна
opponents.scientific_degree: Доктор медицинских наук
opponents.speciality_code: Эпидемиология
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Жоголев Сергей Дмитриевич
opponents.scientific_degree: Доктор медицинских наук
opponents.speciality_code: Эпидемиология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ФГБОУ ВО СЗГМУ ИМ. И.И. МЕЧНИКОВА МИНЗДРАВА РОССИИ
protection_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "СЕВЕРО-ЗАПАДНЫЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ И.И. МЕЧНИКОВА" МИНИСТЕРСТВА ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
protection_organization.ogrn: 1117847434990
protection_organization.supervisor_name: Сергей
protection_organization.supervisor_surname: Сайганов
protection_organization.supervisor_patronymic: Анатольевич
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство здравоохранения Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ФГБОУ ВО СЗГМУ ИМ. И.И. МЕЧНИКОВА МИНЗДРАВА РОССИИ
author_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "СЕВЕРО-ЗАПАДНЫЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ МЕДИЦИНСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ И.И. МЕЧНИКОВА" МИНИСТЕРСТВА ЗДРАВООХРАНЕНИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
author_organization.ogrn: 1117847434990
author_organization.supervisor_name: Сергей
author_organization.supervisor_surname: Сайганов
author_organization.supervisor_patronymic: Анатольевич
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство здравоохранения Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения