name: Антимикробные пептиды секрета слюнных клеток медицинской пиявки Hirudo medicinalis
keyword_list: биоинформатика протеом геном гемолитичность цитотоксичность врожденный иммунитет альфа_спиральная структура Антимикробные пептиды
abstract: Проведен системный анализ медицинской пиявки Hirudo medicinalis с целью идентификации новых антимикробных пептидов (АМП) секрета слюнных клеток (ССК) H. medicinalis и изучении их структурно-функциональных свойств. Определен геном H. medicinalis, проведена аннотация генов и проанализирован протеом ССК H. medicinalis. Оптимизирован биоинформатический алгоритм идентификации АМП в геноме, нацеленный на поиск последовательностей, кодирующих короткие катионные пептиды с тенденцией к образованию α-спиральных структур. С помощью алгоритма в геноме H. medicinalis найден ряд АМП, определена их антимикробная активность в отношении Escherichia coli, Bacillus subtilis, внутриклеточного патогена Chlamydia trachomatis, оценено их гемолитическое действие и цитотоксичность. Изучена пространственная структура АМП методом ЯМР-спектроскопии высокого разрешения. Исследован мембранолитический механизм действия наиболее активных АМП с использованием сканирующей электронной микроскопии и модельных липосом
chairman_dissertation_council.name: Александр
chairman_dissertation_council.surname: Арчаков
chairman_dissertation_council.patronymic: Иванович
chairman_dissertation_council.position: Научный руководитель Института, гл. научн. сотр.
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
chairman_dissertation_council.rank: Академик
chairman_dissertation_council.wos_research_id: В-5194-2012
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 36049531500, 57202449291
chairman_dissertation_council.rinc_id: 78435
chairman_dissertation_council.orcid: -
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Елена
organization_supervisor.surname: Пономаренко
organization_supervisor.patronymic: Александровна
organization_supervisor.position: Директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 31.23.27
rubrics.name: Пептиды, белки
rubrics.code: 31.27.22
rubrics.name: Антимикробные агенты
oecds.code: 01.06.MC
oecds.name: MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
oecds.code: 01.06.CQ
oecds.name: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
speciality_codes.name: Биохимия
speciality_codes.code: 03.01.04
supervisors.fio: Лазарев В.Н.
supervisors.scientific_degree: Доктор биологических наук
supervisors.speciality_code: Молекулярная биология
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Шмаров М.М.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Клиническая иммунология, аллергология
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Рогожин Е.А.
opponents.scientific_degree: Кандидат химических наук
opponents.speciality_code: Биоорганическая химия
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИБМХ
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича"
protection_organization.ogrn: 1027739053792
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ФГБУ ФНКЦ ФХМ ФМБА РОССИИ
author_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ НАУЧНО-КЛИНИЧЕСКИЙ ЦЕНТР ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКОЙ МЕДИЦИНЫ ФЕДЕРАЛЬНОГО МЕДИКО-БИОЛОГИЧЕСКОГО АГЕНТСТВА"
author_organization.ogrn: 1027739756428
author_organization.supervisor_name: ВАДИМ
author_organization.supervisor_surname: ГОВОРУН
author_organization.supervisor_patronymic: МАРКОВИЧ
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Федеральное медико-биологическое агентство
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения