name: Молекулярно-генетическая характеристика вариантов ВИЧ-1, циркулировавших на территории Московской области в 2011-2016 гг., и анализ мутаций лекарственной устойчивости к антиретровирусным препаратам
keyword_list: антиретровирусные препараты лекарственная устойчивость мутация ВИЧ-1
abstract: ВИЧ-инфекция – приоритетная проблема глобального здравоохранения [ВОЗ, 2020]. Антиретровирусная терапия (АРТ) единственный способ сохранения жизни ВИЧ-инфицированных, однако циркуляция лекарственно-устойчивых (ЛУ) вирусов привносит серьезные ограничения в реализацию успешных схем терапии. Надзор за ЛУ, а так же анализ мутаций – способ повышения эффективности терапии. 
  Материалы и методы. Плазма крови, содержащая РНК ВИЧ-1 от 896 ВИЧ-инфицированных пациентов, состоящих на Д-учете в Центре СПИД МО; Он-лайн генотипирование (COMET v. 0.5, REGA HIV-1 Subtyping Tool v. 3.0); филогенетический и филодинамический анализ (попарное и множественное выравнивание последовательностей – алгоритм MAFFT), филогенетические кластеры определяли методом максимального правдоподобия (maximum-likelihood) в приложении IQ-TREE (Nguyen et al., 2015); статистическая поддержка ветвления оценивалась с помощью бутстрэп-теста (bootstrap) при 1000 независимых итераций и теста Шимодайра-Хесагава (Shimodaira–Hasegawa-[aLRT]), анализ мутаций ЛУ с применением специализированных программ.
  Результаты. Доминирующий генетический вариант ВИЧ-1 – суб-субтип А6, выявлены субтипы В, CRF02_AG. Установлено одновременное развитие двух волн эпидемии. Первая вошла в область не ранее середины 80-х годов в группе МСМ (субтип В). Вторая – в середине 90-х годов, связана с ПИН (суб-субтип А6). Выявлено 38 (4,2%) уникальных рекомбинантных форм ВИЧ-1. Преобладают множественно-устойчивые варианты вируса к препаратам классов НИОТ+ННИОТ (M184V, K103N, G109S), среди которых растет доля вирусов с мутациями к препаратам класса ННИОТ (K103N, G109S, K101E, Y181A) с 47,6% в 2011 году до 81,3% в 2016 году. 
  Обсуждение. Доминирование суб-субтип А6 характерно для эпидемии ВИЧ-инфекции в РФ, однако, напряженные миграционные процессы в области создают благоприятную почву для образования новых рекомбинантных форм вируса. Преобладание множественно-устойчивых вариантов вируса к препаратам классов НИОТ+ННИОТ вероятно, связано с широким применением препаратов этих классов в схемах терапии. Остановить рост доли вирусов с мутациями к препаратам класса ННИОТ возможно преимущественным использованием в повседневной практике препаратов с высоким генетически барьером ЛУ.
chairman_dissertation_council.name: Дмитрий
chairman_dissertation_council.surname: Львов
chairman_dissertation_council.patronymic: Константинович
chairman_dissertation_council.position: главный научный сотрудник
chairman_dissertation_council.degree: Доктор медицинских наук
chairman_dissertation_council.rank: Академик
chairman_dissertation_council.wos_research_id: E-8117-2014
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 7102365160
chairman_dissertation_council.rinc_id: 9207
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Александр
organization_supervisor.surname: Гинцбург
organization_supervisor.patronymic: Леонидович
organization_supervisor.position: директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.25.37
rubrics.name: Вирусные препараты
rubrics.code: 76.03.41
rubrics.name: Медицинская вирусология
oecds.code: 01.06.ZE
oecds.name: VIROLOGY
speciality_codes.name: Вирусология
speciality_codes.code: 03.02.02
supervisors.fio: Бобкова М.Р.
supervisors.scientific_degree: Доктор биологических наук
supervisors.speciality_code: Эпидемиология
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
supervisors.fio: Пронин А.Ю.
supervisors.scientific_degree: Кандидат медицинских наук
supervisors.speciality_code: Клиническая иммунология, аллергология
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Останкова Ю.В.
opponents.scientific_degree: Кандидат биологических наук
opponents.speciality_code: Вирусология
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Годков М.А.
opponents.scientific_degree: Доктор медицинских наук
opponents.speciality_code: Эпидемиология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ФГБУ "НИЦЭМ им. Н.Ф.Гамалеи" Минздрава России
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф.Гамалеи" Министерства здравоохранения Российской Федерации
protection_organization.ogrn: 1027739443555
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство здравоохранения Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ФГБУ "НИЦЭМ им. Н.Ф.Гамалеи" Минздрава России
author_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф.Гамалеи" Министерства здравоохранения Российской Федерации
author_organization.ogrn: 1027739443555
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство здравоохранения Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения