name: Перекодирование белков в центральной нервной системе модельных организмов и человека вследствие редактирования матричной РНК аденозиндезаминазами
keyword_list: Drosophila melanogaster протеом мозга протеогеномика нейродегенеративные заболевания редактирование РНК РНК-зависимая аденозиндезаминаза (АDAR)
abstract: Впервые исследованы протеомы головного мозга дрозофилы, мыши и человека для выявления в этих организмах перекодирования белков вследствие дезаминирования аденозина в мРНК ферментами ADAR. Методами таргетной протеомики показано, что некоторые белки в мозге насекомого и мыши перекодированы в значительной степени. Редактирование РНК потенциально образует тысячи аминокислотных замен, но до уровня детектирования с помощью протеомного анализа доходят лишь 1% у дрозофилы из 8 тысяч предсказанных сайтов и 2-3% у млекопитающих из 1-2 тыс. таких сайтов. В работе продемонстрирован подход и инструменты, которые могут использоваться для анализа роли редактирования РНК в моделях патологических процессов, а также для поиска перекодированных протеоформ в качестве биомаркеров различных патологий нервной системы.
  Автор проводил поиск и анализ литературы, планирование экспериментов, пробоподготовку к анализу нуклеиновых кислот и протеомный анализ данных, интерпретацию результатов и подготовку публикаций. 
  Диссертация выполнена в ФГБНУ «Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича». Научный руководитель – д.б.н., профессор РАН Мошковский Сергей Александрович. Официальные оппоненты – д.б.н., член-корреспондент РАН Москалев Алексей Александрович и к.б.н. Клычников Олег Игоревич. Ведущая организация –ФГБУН Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук. Основные публикации - Kliuchnikova A.A., и др. Proteome-Wide Analysis of ADAR-Mediated Messenger RNA Editing during Fruit Fly Ontogeny // Journal of Proteome Research. 2020. Vol. 19, №10. P. 4046-4060; Levitsky L.I., Kliuchnikova A.A., Kuznetsova K.G. и др. Adenosine-to-Inosine RNA Editing in Mouse and Human Brain Proteomes // Proteomics. 2019. Vol. 19, №23. P. 1900195;
  Kuznetsova K.G., Kliuchnikova A.A., Ilina I.U. и др. Proteogenomics of Adenosine-to-Inosine RNA Editing in the Fruit Fly // Journal of Proteome Research. 2018. Vol. 17, №11. P. 3889–3903.
chairman_dissertation_council.name: Александр
chairman_dissertation_council.surname: Арчаков
chairman_dissertation_council.patronymic: Иванович
chairman_dissertation_council.position: Главный научный сотрудник, научный руководитель Института
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
chairman_dissertation_council.rank: Академик
chairman_dissertation_council.wos_research_id: В-5194-2012
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 36049531500, 57202449291
chairman_dissertation_council.rinc_id: 78435
chairman_dissertation_council.orcid: -
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Елена
organization_supervisor.surname: Пономаренко
organization_supervisor.patronymic: Александровна
organization_supervisor.position: Директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.15.05
rubrics.name: Методы и аппаратура в молекулярной биологии
rubrics.code: 34.15.01
rubrics.name: Общие вопросы
rubrics.code: 34.15.43
rubrics.name: Молекулярная нейробиология
oecds.code: 03.01.RU
oecds.name: NEUROSCIENCES
oecds.code: 01.06.CO
oecds.name: BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS
oecds.code: 01.06.CQ
oecds.name: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
speciality_codes.name: Биохимия
speciality_codes.code: 03.01.04
supervisors.fio: Мошковский С.А.
supervisors.scientific_degree: Доктор биологических наук
supervisors.speciality_code: Биохимия
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Москалев А.А.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Радиобиология
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Клычников О.И.
opponents.scientific_degree: Кандидат биологических наук
opponents.speciality_code: Молекулярная биология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИБМХ
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича"
protection_organization.ogrn: 1027739053792
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ИБМХ
author_organization.name: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича"
author_organization.ogrn: 1027739053792
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения