name: Изменения метилирования ДНК в ответ на появление онкогенных мутаций и при адаптации к внешней среде
keyword_list: Метилирование ДНК гипоксия рак почки колюшка адаптация
abstract: Метилирование ДНК – одна из важнейших эпигенетических модификаций, играющих ключевую роль в процессах развития организма и при формировании раковых опухолей. Целью данной диссертационной работы было исследовать изменения профилей метилирования генома в ответ на воздействие в двух биологических системах: при инактивации ключевого онкосупрессора рака почки – гена VHL в клеточной линии рака почки и при адаптации морских рыб колюшек к пресной воде. Было показано, что инактивация гена VHL приводит к гиперметилированию генома, при этом экзогенная реактивация VHL приводит к частичному восстановлению фенотипа. Предложен новый механизм гиперметилирования генома, связанный с транскриптомным ответом на гипоксию и накоплением 2-гидроксиглутарата, но не связанный с мутациями в генах изоцитрат дегидрогеназ (IDH). При исследовании адаптации трёхиглой колюшки к пресной воде было показано, что среди генов, дифференциально метилированных между морской и пресноводной популяцией рыб, перепредставлены гены ионных каналов. Таким образом, дифференциальное метилирование действует на те же функциональные категории генов, что и генетический отбор, но затрагивает другие индивидуальные гены. Также была исследована кратковременная адаптация рыб к пресной воде. Изменения метилирования ДНК при кратковременном перемещении морской колюшки в пресную воду на 4 суток были схожи с разницей метилирования ДНК между морской и пресноводной популяциями.
chairman_dissertation_council.name: Витаутас-Юозапас
chairman_dissertation_council.surname: Швядас
chairman_dissertation_council.patronymic: Каятоно
chairman_dissertation_council.position: профессор
chairman_dissertation_council.degree: Доктор химических наук
chairman_dissertation_council.rank: Профессор
chairman_dissertation_council.wos_research_id: J-6594-2012
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 7004619816
chairman_dissertation_council.rinc_id: 82145
chairman_dissertation_council.url: https://istina.msu.ru/profile/Svedas
chairman_dissertation_council.orcid: 0000-0002-1664-0307
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Владимир
organization_supervisor.surname: Скулачев
organization_supervisor.patronymic: Петрович
organization_supervisor.position: директор НИИ ФХБ МГУ
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.15.29
rubrics.name: Молекулярная эволюция
rubrics.code: 34.15.61
rubrics.name: Молекулярные критерии адаптации
rubrics.code: 34.15.51
rubrics.name: Молекулярная онкология
rubrics.code: 34.03.23
rubrics.name: Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
rubrics.code: 31.27.31
rubrics.name: Биохимия опухолей
oecds.code: 01.06.MC
oecds.name: MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
speciality_codes.name: Математическая биология, биоинформатика
speciality_codes.code: 03.01.09
supervisors.fio: Прохорчук Е.Б.
supervisors.scientific_degree: Доктор биологических наук
supervisors.speciality_code: Молекулярная биология
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Макеев В.Ю.
opponents.scientific_degree: Доктор физико-математических наук
opponents.speciality_code: Биофизика
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Базыкин Г.А.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Математическая биология, биоинформатика
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Кантидзе О.Л.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Молекулярная биология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ М.В.ЛОМОНОСОВА, МГУ ИМЕНИ М.В.ЛОМОНОСОВА, МОСКОВСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИЛИ МГУ
protection_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ М.В.ЛОМОНОСОВА"
protection_organization.ogrn: 1037700258694
protection_organization.supervisor_name: ВИКТОР
protection_organization.supervisor_surname: САДОВНИЧИЙ
protection_organization.supervisor_patronymic: АНТОНОВИЧ
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ФИЦ БИОТЕХНОЛОГИИ РАН
author_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР "ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ОСНОВЫ БИОТЕХНОЛОГИИ" РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК"
author_organization.ogrn: 1037700131633
author_organization.supervisor_name: АЛЕКСЕЙ
author_organization.supervisor_surname: ФЕДОРОВ
author_organization.supervisor_patronymic: НИКОЛАЕВИЧ
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения