name: Молекулярно-генетическое типирование Mycobacterium tuberculosis, выявление мутаций генома, вызывающих резистентность к противотуберкулезным препаратам
keyword_list: Mycobacterium tuberculosis резистентность к противотуберкулезным препаратам Молекулярно-генетическое типирование
abstract: Принципы молекулярной эпидемиологии, сформулированные несколько десятилетий назад, создали новый взгляд на динамику трансмиссии и способствовали изменению фокусов и обновлению практики контроля туберкулезной инфекции. Проведенное глубокое исследование генома микобактерий способствовало установлению новых связей между эпидемиологией, клиникой заболевания и генетическими вариациями, связанными с вирулентностью и трансмиссивностью. Молекулярно-эпидемиологические исследования вспышек туберкулеза с большим числом случаев заражения выявили, что больные заражены штаммами, имеющими идентичный генотип и классифицируются в эпидемиологически связанные кластеры, но только некоторые случаи такой трансмиссии могут быть подтверждены методами традиционной эпидемиологии.
  Сибирский регион РФ традиционно являлся одним из наиболее отягощенных туберкулезной инфекцией. В начале двухтысячных годов, когда начиналось настоящее исследование, заболеваемость и смертность от туберкулеза в Сибири составляли 160 и 25 на 100000 населения, соответственно. В тоже время, полностью отсутствовало изучении динамики трансмиссии туберкулеза и факторов лекарственной резистентности современными молекулярно-эпидемиологическими методами.
  Таким образом, изучение клональной генетической структуры изолятов микобактерий, частоты и спектра мутаций, обуславливающих резистентность к лекарственным препаратам, в специфических популяциях и на определенных территориях играет ключевую роль, как в планировании противотуберкулезных мероприятий, так и в фундаментальном понимании эволюции этого опасного инфекционного агента. 
   Основной целью настоящей работы было изучение генетических особенностей изолятов M.tuberculosis, циркулирующих на территории бывшего Советского Союза, а также разработка новых подходов для клинической диагностики туберкулеза. 
  В проведенном нами исследовании реализован комплексный подход к молекулярно-генетической характеризации изолятов M.tuberculosis. На момент начала этого исследования нами впервые были получены данные о клональной структуре изолятов M.tuberculosis в Западно-Сибирском регионе России, определен спектр и частоты мутаций, вызывающих резистентность к рифапмицину. Впервые подробно охарактеризована коллекция изолятов M.tuberculosis, в том числе XDR-типа, циркулирующих на Новосибирской области. Разработан эффективный метод высокоразрешающего типирования изолятов семейства Beijing, получены данные о частотах встречаемости упешного росссийского клона B0/W148 в Западно-Сибирском регионе, что в дальнейшем позволило ряду других исследователей предложить теорию распространения этого клона в России и прилегающих странах. Нами был впервые изучен молекулярный профиль изолятов с XDR, циркулирующих на территории Западной Сибири, предложен ряд оригинальных методических подходов для выявления основных частотных мутаций, вызывающих лекарственную резистентность у микобактерий туберкулеза. Идентифицированы ассоциации принадлежности к определенному семейству/подсемейству M. tuberculosis с наличием таких мутаций.
chairman_dissertation_council.name: Дмитрий
chairman_dissertation_council.surname: Пышный
chairman_dissertation_council.patronymic: Владимирович
chairman_dissertation_council.position: г.н.с.
chairman_dissertation_council.degree: Доктор химических наук
chairman_dissertation_council.rank: Член-корреспондент РАН
chairman_dissertation_council.wos_research_id: F-4729-2013
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 7006677629
chairman_dissertation_council.rinc_id: 79386
chairman_dissertation_council.orcid: 0000-0002-2587-3719
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Владимир
organization_supervisor.surname: Коваль
organization_supervisor.patronymic: Васильевич
organization_supervisor.position: и.о. директора
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 31.23.25
rubrics.name: Антибиотики
rubrics.code: 34.15.63
rubrics.name: Молекулярная фармакология и токсикология
rubrics.code: 34.15.29
rubrics.name: Молекулярная эволюция
oecds.code: 01.06.CU
oecds.name: BIOLOGY
oecds.code: 01.06.CO
oecds.name: BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS
oecds.code: 01.06.CQ
oecds.name: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
speciality_codes.name: Молекулярная биология
speciality_codes.code: 1.5.3.
supervisors.fio: Власов В. В.
supervisors.scientific_degree: Доктор химических наук
supervisors.speciality_code: Биохимия
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Тикунова Н. В.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Молекулярная биология
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Шемякин И. Г.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Вирусология
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Лунин В. Г.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Вирусология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИХБФМ СО РАН
protection_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ ИНСТИТУТ ХИМИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ И ФУНДАМЕНТАЛЬНОЙ МЕДИЦИНЫ СИБИРСКОГО ОТДЕЛЕНИЯ РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК
protection_organization.ogrn: 1025403659852
protection_organization.supervisor_name: ДМИТРИЙ
protection_organization.supervisor_surname: ПЫШНЫЙ
protection_organization.supervisor_patronymic: ВЛАДИМИРОВИЧ
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ИХБФМ СО РАН
author_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ ИНСТИТУТ ХИМИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ И ФУНДАМЕНТАЛЬНОЙ МЕДИЦИНЫ СИБИРСКОГО ОТДЕЛЕНИЯ РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК
author_organization.ogrn: 1025403659852
author_organization.supervisor_name: ДМИТРИЙ
author_organization.supervisor_surname: ПЫШНЫЙ
author_organization.supervisor_patronymic: ВЛАДИМИРОВИЧ
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения