name: Роль нуклеотидного состава 5′-области мРНК в эффективности экспрессии генов в растениях
keyword_list: полисомное профилирование 5'-нетранслируемая область нуклеотидный состав эффективность Трансляция
abstract: В диссертации проведен поиск регуляторных нуклеотидных контекстов в 5`-НТО мРНК растений A. thaliana.
  Впервые сконструирована синтетическая последовательность, которая содержит CG-богатые мотивы, выявленные на основании in silico анализа 5′-областей генов растений A. thaliana. На трансгенных растениях табака изучен вклад нуклеотидного состава 5′-области мРНК в эффективность экспрессии на уровне транскрипции и трансляции с использованием репортерного гена термостабильной лихеназы. 
  Впервые показано, что синтетическая CG-богатая последовательность в 5'-области гена достоверно увеличивает уровень транскрипции репортерного гена и не оказывает негативного влияния на эффективность трансляции мРНК репортера. 
  Разделение пулов мРНК A. thaliana, ассоциированных с моносомной и полисомной фракцией, методом профилирования полисом и анализ транскриптов, ассоциированных с каждым пулом мРНК, позволили определить трансляционную эффективность индивидуальных мРНК, а последующий in silico анализ – провести поиск регуляторных контекстов в 5′-области мРНК растений A. thaliana, которые могут быть потенциально важными для эффективной трансляции мРНК.
  Впервые на основе in silico анализа выборки стабильно транскрибируемых во время онтогенеза генов A. thaliana установлено, что пиримидиновые динуклеотиды и мотивы характерны для 5′-НТО мРНК с высокой трансляционной эффективностью, тогда как пуриновые динуклеотиды и мотивы ассоциированы с транскриптами, имеющими низкую трансляционную эффективность.
chairman_dissertation_council.name: Дмитрий
chairman_dissertation_council.surname: Лось
chairman_dissertation_council.patronymic: Анатольевич
chairman_dissertation_council.position: директор
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
chairman_dissertation_council.rank: Член-корреспондент РАН
chairman_dissertation_council.wos_research_id: С-6608-2013
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: -
chairman_dissertation_council.rinc_id: 90053
chairman_dissertation_council.orcid: -
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Дмитрий
organization_supervisor.surname: Лось
organization_supervisor.patronymic: Анатольевич
organization_supervisor.position: директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.23.57
rubrics.name: Генетика и селекция растений
rubrics.code: 34.31.27
rubrics.name: Рост и развитие растений
oecds.code: 01.06.DE
oecds.name: PLANT SCIENCES
speciality_codes.name: Физиология и биохимия растений
speciality_codes.code: 03.01.05
supervisors.fio: Голденкова-Павлова И.В.
supervisors.scientific_degree: Доктор биологических наук
supervisors.speciality_code: Генетика
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Дейнеко Е.В.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Генетика
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Ермошин А.А.
opponents.scientific_degree: Кандидат биологических наук
opponents.speciality_code: Физиология и биохимия растений
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИФР РАН
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт физиологии растений им. К.А. Тимирязева Российской академии наук
protection_organization.ogrn: 1027739505408
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ИФР РАН
author_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт физиологии растений им. К.А. Тимирязева Российской академии наук
author_organization.ogrn: 1027739505408
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения