name: Экспрессия генов Escherichia coli в ответ на нетермическое воздействие терагерцового излучения
keyword_list: генная экспрессия флуоресценция, биосенсор, нетермическое воздействие, терагерцовое излучение, Escherichia coli, Escherichia coli, терагерцовое излучение, нетермическое воздействие, биосенсор, флуоресценция, генная экспрессия
abstract: С помощью современных методов молекулярной биологии и микробиологии разработано четыре биосенсора, маркирующих активность генных промоторов PmatA, PsafA, PchbB и PtdcR и соответствующих ТГц-чувствительных генных сетей клеток E. coli, задействованных в формировании биоплёнки, многокомпонентной антистрессовой защите, усвоении хитобиозы и целлобиозы, метаболизме серина и треонина. Методами спектрометрии, флуориметрии и молекулярной биологии исследована ответная реакция генных сетей на воздействие тепловым шоком, химическим стрессом и ТГц излучением от двух источников с различными физическими параметрами. Показана нетермическая реакция и специфичность активации по отношению ТГц излучению указанных сетей при воздействии на биосенсоры излучением с частотами 2,31 и 0,14 ТГц. Также показано влияние состава питательной среды на ТГц-обусловленную реакцию генных сетей. 
  Соискатель принимал непосредственное участие в постановке задач, планировании и выполнении экспериментов, обработке данных; им лично выполнена основная часть экспериментальной и теоретической работы.
  Диссертация имеет новизну, заключающейся в разработке нового, биосенсорного, инструментария для оценки функционирования определённых прокариотических генных сетей, и получении новых сведений по влиянию электромагнитного излучения ТГц диапазона на живые объекты. Практическая значимость диссертации заключается в возможности применения полученных биосенсоров в научно-исследовательской практике, связанной с необходимостью анализа активности промоторов PmatA, PsafA, PchbB и PtdcR в клетках E. coli, в том числе вне ТГц тематики, а также для разработки систем ТГц мониторинга окружающей среды. 
  Работа выполнена в ФГБУН «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики СО РАН» (ИЦиГ СО РАН) и ФГБУН Институт лазерной физики СО РАН. Официальные оппоненты: Артюхов В. Г., доктор биол. наук, проф., ФГБОУ ВПО «Воронежский государственный университет»; Тутукина М.Н., канд. биол. наук, Институт биофизики клетки РАН — обособленное подразделение ФГБУН «Федеральный исследовательский центр «Пущинский научный центр биологических исследований РАН». Ведущая организация: ФГБУН Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН. Научные руководители: канд. биол. наук Пельтек С.Е., ФГБУН ИЦиГ СО РАН; доктор биол. наук Черкасова О.П., ФГБУН Институт лазерной физики СО РАН.
  Наиболее значимые публикации автора по теме диссертации: Serdyukov D.S. et al. Fluorescent bacterial biosensor E. coli/pTdcR-TurboYFP sensitive to terahertz radiation // Biomedical Optics Express. 2021. V. 12, No. 2. P. 705–721; Serdyukov D.S. et al. Study on the effects of terahertz radiation on gene networks of Escherichia coli by means of fluorescent biosensors // Biomedical Optics Express. 2020. V. 11, No. 9. P. 5258–5273; Сердюков Д.С. и др. Штамм бактерии Escherichia coli/pTdcR-TurboYFP, обладающий чувствительностью к терагерцовому излучению // Патент РФ № 2691308. 2019. 11 с.
chairman_dissertation_council.name: Евгений
chairman_dissertation_council.surname: Фесенко
chairman_dissertation_council.patronymic: Евгеньевич
chairman_dissertation_council.position: заведующий лабораторией
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
chairman_dissertation_council.rank: Член-корреспондент РАН
chairman_dissertation_council.wos_research_id: С-7437-2015
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 7101769087
chairman_dissertation_council.rinc_id: 78364
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Павел
organization_supervisor.surname: Грабарник
organization_supervisor.patronymic: Яковлевич
organization_supervisor.position: директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 29.35.33
rubrics.name: Миллиметровые и субмиллиметровые волны
rubrics.code: 34.49.05
rubrics.name: Методы и аппаратура в радиобиологии
rubrics.code: 34.49.19
rubrics.name: Молекулярная и клеточная радиобиология
rubrics.code: 34.15.27
rubrics.name: Генетическая инженерия
rubrics.code: 34.15.23
rubrics.name: Молекулярная генетика
oecds.code: 02.08.DB
oecds.name: BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY
oecds.code: 01.06.DA
oecds.name: BIOPHYSICS
oecds.code: 01.06.CQ
oecds.name: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
speciality_codes.name: Молекулярная биология
speciality_codes.code: 03.01.03
supervisors.fio: Пельтек  С.Е.
supervisors.scientific_degree: Кандидат биологических наук
supervisors.speciality_code: Генетика
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
supervisors.fio: Черкасова О.П.
supervisors.scientific_degree: Доктор биологических наук
supervisors.speciality_code: Патологическая физиология
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Артюхов В.Г.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Биохимия
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Тутукина М.Н.
opponents.scientific_degree: Кандидат биологических наук
opponents.speciality_code: Молекулярная биология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ФИЦ ПНЦБИ РАН
protection_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР "ПУЩИНСКИЙ НАУЧНЫЙ ЦЕНТР БИОЛОГИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЙ РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК"
protection_organization.ogrn: 1025007768983
protection_organization.supervisor_name: ПАВЕЛ
protection_organization.supervisor_surname: ГРАБАРНИК
protection_organization.supervisor_patronymic: ЯКОВЛЕВИЧ
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ИЛФ СО РАН
author_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт лазерной физики Сибирского отделения Российской академии наук
author_organization.ogrn: 1025403665572
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения