name: Влияние модуляции путей репарации нуклеолитических разрывов в геноме вируса гепатита В на противовирусное действие CRISPR/Cas9
keyword_list: ВИРУС ГЕПАТИТА В, ПУТИ РЕПАРАЦИИ,  НУКЛЕОЛИТИЧЕСКИЕ РАЗРЫВЫ,  ГЕНОМ ВИРУСА ГЕПАТИТА В, CRISPR/CAS9, ПРОТИВОВИРУСНОЕ ДЕЙСТВИЕ, NHEJ, HR, НИЗКОМОЛЕКУЛЯРНЫЕ СОЕДИНЕНИЯ,  NU7026
abstract: В мире более 250 миллионов человек хронически инфицированы вирусом гепатита В, при этом смертность из-за последствий хронической инфекции составляет более 1 миллиона человек в год. Системы нуклеаз CRISPR/Cas9 являются перспективными инструментами для создания противовирусных препаратов, в том числе для разрушения ключевой формы генома вируса гепатита В, кольцевой ковалентно замкнутой ДНК (ккзДНК), и лечения хронической инфекции. Считается, что действие CRISPR/Cas9 на ккзДНК вируса гепатита В связано с внесением мутаций в целевые регионы и подавлением транскрипции вируса, при этом часть пула ккзДНК может подвергаться деградации. Тем не менее, системы CRISPR/Cas9 часто оказываются неэффективны, поскольку существенная доля ккзДНК в инфицированных клетках остается интактной, при этом даже одна молекула ккзДНК может запускать полноценный цикл инфекции. Использован ряд низкомолекулярных модуляторов путей репарации двуцепочечных разрывов ДНК с целью увеличения противовирусной активности систем CRISPR/Cas9 на моделях вируса гепатита В. Выявлено, что большинство известных низкомолекулярных соединений не оказывает влияния на активность CRISPR/Cas9. Ингибитор пути репарации NHEJ усиливает действие CRISPR/Cas9 на вирус гепатита В, более эффективно снижая транскрипцию вируса и уровни ДНК. С помощью ПЦР и высокопроизводительного секвенирования оказано, что использование соединения NU7026 препятствует разрушению ккзДНК вируса и вызывает ее гиперредактирование в сайтах разрезания. Полученные результаты указывают на то, что системы CRISPR/Cas9 с выбранными РНК-проводниками позволяют эффективно разрушать ккзДНК вируса гепатита В, в то время как использование ингибитора NHEJ NU7026 препятствует деградации ккзДНК и может быть использовано как тест для оценки уровней разрушения вирусного генома и эффективности противовирусного действия.
chairman_dissertation_council.surname: Львов Д.К.
chairman_dissertation_council.position: главный научный сотрудник
chairman_dissertation_council.degree: Доктор медицинских наук
organization_supervisor.surname: Гинцбург А. Л.
organization_supervisor.position: директор
organization_supervisor.degree: Доктор биологических наук
rubrics.code: 34.25.19
rubrics.name: Репликация вирусов
rubrics.code: 34.25.29
rubrics.name: Биология вирусов человека, животных, растений и бактерий
oecds.code: 01.06.00
oecds.name: Biological sciences
oecds.code: 01.06.ZE
oecds.name: VIROLOGY
speciality_codes.name: Вирусология
speciality_codes.code: 03.02.02
supervisors.fio: Чуланов В.П.
supervisors.scientific_degree: Доктор медицинских наук
supervisors.speciality_code: Эпидемиология
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Михайлов М.И.
opponents.scientific_degree: Доктор медицинских наук
opponents.speciality_code: Вирусология
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Карганова Г.Г.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Вирусология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ФГБУ "НИЦЭМ им. Н.Ф.Гамалеи" Минздрава России
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф.Гамалеи" Министерства здравоохранения Российской Федерации
protection_organization.ogrn: 1027739443555
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство здравоохранения Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора
author_organization.name: Федеральное бюджетное учреждение науки "Центральный научно-исследовательский институт эпидемиологии" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
author_organization.ogrn: 1027700046615
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения