name: Разработка алгоритмов для сборки геномов и транскриптомов
keyword_list: СБОРКА ГЕНОМА, СБОРКА ТРАНСКРИПТОМА, СЕКВЕНИРОВАНИЕ, РАЗРЕШЕНИЕ ГЕНОМНЫХ ПОВТОРОВ
abstract: Цель: разработка алгоритмов сборки геномов и транскриптомов, позволяющих получать более качественные результаты по сравнению с существующими аналогами. Применены новые методы сборки. Разработаны геномный сборщик SPAdes, входящий в него модуль для разрешения геномных повторов и скаффолдинга (exSPAnder), а также транскриптомный сборщик rnaSPAdes.
chairman_dissertation_council.surname: Подгорная О.И.
chairman_dissertation_council.position: проф. Каф. цитологии и гистологии
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
organization_supervisor.surname: Гнетов А.В.
organization_supervisor.position: Ученый секретарь СПбГУ
organization_supervisor.degree: Кандидат биологических наук
rubrics.code: 34.03.23
rubrics.name: Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
oecds.code: 01.06.CU
oecds.name: BIOLOGY
speciality_codes.name: Математическая биология, биоинформатика
speciality_codes.code: 03.01.09
supervisors.fio: Лапидус А.Л.
supervisors.scientific_degree: Кандидат биологических наук
supervisors.speciality_code: Математическая биология, биоинформатика
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: -
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербургский университет, СПбГУ
protection_organization.name: федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский государственный университет"
protection_organization.ogrn: 1037800006089
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Правительство Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: Санкт-Петербургский государственный университет, Санкт-Петербургский университет, СПбГУ
author_organization.name: федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования "Санкт-Петербургский государственный университет"
author_organization.ogrn: 1037800006089
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Правительство Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения