name: Разработка подхода к активации внутриклеточных факторов противовирусной устойчивости APOBEC/AID с помощью липофекции химерных систем CRISPR/CAS9 для элиминации вируса гепатита В
keyword_list: интерферон-стимулируемые гены ккзДНК CRISPR-активация APOBEC/AID
abstract: Вирусный гепатит В (ВГВ) является тяжелым инфекционным заболеванием, которое может протекать в острой (ОГВ) или хронической (ХГВ) форме. По данным ВОЗ, распространенность хронической инфекции составляет около 257 млн человек, а смертность от основных исходов ХГВ - цирроза и гепатоцеллюлярной карциномы - превышает 1 млн человек в год. Причиной хронизации инфекции является особая геномная форма вируса гепатита В - кольцевая ковалентно-замкнутая ДНК (ккзДНК ВГВ). Одними из наиболее известных факторов рестрикции ВГВ-инфекции являются факторы семейства АРОВЕС/AID. Установлено, что вирусный HBc-антиген (HBcAg) является фактором, который привлекает АРОВЕС3А, APOBEC3B и AID к персистентной форме генома ВГВ – ккзДНК – с последующим дезаминированием и деградацией вирусных геномов. В клинических испытаниях у пациентов с ХГВ практически все иммунотерапевтические препараты оказывают слабо выраженное противовирусное действие. Основной причиной этого является то, что сигнальные пути рецепторов врожденного иммунитета – мишени для действия иммунотерапевтических препаратов – блокированы белковыми продуктами ВГВ. Разработка подхода к нецитолитическому разрушению и элиминации ккзДНК ВГВ из заражённых клеток не за счет действия на рецепторы иммунного ответа, а напрямую, с помощью активации экспрессии генов факторов с противовирусной активностью, в частности, генов АРОВЕС и AID, является новым и перспективным направлением для лечения ХГВ. Цель диссертационной работы - разработать подход к активации экспрессии генов с противовирусной активностью APOBEC и AID с помощью липофекции систем активации транскрипции CRISPR/dCas9-p300Core для элиминации ВГВ из заражённых клеток. В работе показано, что активация экспрессии APOBEC и AID вызывает деградацию большинства персистентных форм вируса (ккзДНК), блокирует вирусную транскрипцию и образование вирусных белков. При этом, оставшиеся молекулы ккзДНК содержат большое количество мутаций по типу инсерций, делеций и нуклеотидных замен, и, следовательно, не способны поддерживать вирусный цикл. Предложенный подход в дальнейшем может быть использован для изучения взаимодействия вирусов с клеточными белками, включая изучение внутриклеточных факторов с противовирусной активностью. В работе также установлено, что кратковременная активация экспрессии APOBEC3A и APOBEC3B не вызывает выраженной цито- или генотоксичности.
chairman_dissertation_council.name: Рахим
chairman_dissertation_council.surname: Хаитов
chairman_dissertation_council.patronymic: Мусаевич
chairman_dissertation_council.position: Научный руководитель института
chairman_dissertation_council.degree: Доктор медицинских наук
chairman_dissertation_council.rank: Академик
chairman_dissertation_council.wos_research_id: ABB-6616-2020
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 7102839432
chairman_dissertation_council.rinc_id: 108140
chairman_dissertation_council.orcid: https://orcid.org/0000-0002-2397-5172
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Муса
organization_supervisor.surname: Хаитов
organization_supervisor.patronymic: Рахимович
organization_supervisor.position: Директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.15.33
rubrics.name: Молекулярная иммунология
rubrics.code: 34.43.59
rubrics.name: Инфекционная иммунология
rubrics.code: 34.25.23
rubrics.name: Противовирусный иммунитет
oecds.code: 01.06.ZE
oecds.name: VIROLOGY
oecds.code: 03.01.NI
oecds.name: IMMUNOLOGY
speciality_codes.name: Вирусология
speciality_codes.code: 03.02.02
speciality_codes.name: Иммунология
speciality_codes.code: 03.03.03
supervisors.fio: Смирнов В.В.
supervisors.scientific_degree: Доктор фармацевтических наук
supervisors.speciality_code: Фармакология, клиническая фармакология
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
supervisors.fio: Чуланов В.П.
supervisors.scientific_degree: Доктор медицинских наук
supervisors.speciality_code: Инфекционные болезни
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Михайлов М.И.
opponents.scientific_degree: Доктор медицинских наук
opponents.speciality_code: Эпидемиология
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Кадагидзе З.Г.
opponents.scientific_degree: Доктор медицинских наук
opponents.speciality_code: Онкология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ФГБУ "ГНЦ Институт иммунологии" ФМБА России
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение "Государственный научный центр "Институт иммунологии" Федерального медико-биологического агентства
protection_organization.ogrn: 1097746301278
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Федеральное медико-биологическое агентство
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ГНЦ "Институт иммунологии ФМБА России"
author_organization.name: Государственное предприятие Государственный научный центр "Институт иммунологии Федерального медико-биологического агентства"
author_organization.ogrn: 1037739310113
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Федеральное медико-биологическое агентство
author_organization.okopf: Унитарные предприятия, основанные на праве хозяйственного ведения