name: «Переносимые клещами флави- и флавиподобные вирусы, циркулирующие на территории России»
keyword_list: Морфология вирионов Филогенетические взаимоотношения Сегментированный геном Вирус Джингмен Вирус Янггоу Вирус Алонгшан Флавиподобные вирусы Ареал вируса клещевого энцефалита Вирус клещевого энцефалита Флавивирусы
abstract: Особое внимание ученых привлекают границы ареала патогенных для человека и животных арбовирусов, т.к. на границах можно ожидать появление эпидемически значимых вариантов вирусов в связи со сменой переносчиков и основных прокормителей. Наибольшее внимание привлекают вирусы, циркулирующие в кровососущих членистоногих, поскольку они могут являться арбовирусами или могут стать арбовирусами, а также могут влиять на циркуляцию уже известных патогенных для человека арбовирусов. В связи с этим целью данной работы было поиск и характеристика флави- и флавиподобных вирусов, циркулирующих на границе ареала ВКЭ, как наиболее распространенного переносимого клещами флавивируса в России.
  В работе были использованы классические вирусологические и молекулярно-генетические методы, включая высокопроизводительное секвенирование (ВПС).
  В работы была проведена оценка эффективности и чувствительности коммерческих тест-систем по выявлению ВКЭ на основе ИФА и ПЦР-РВ, а также ПЦР с праймерами на род Flavivirus. Коммерческая тест-система по выявлению ВКЭ на основе ИФА давала ложноположительные реакции с микроорганизмами присутствующими в клещах, и с другими представителями рода Flavivirus, в отличие от коммерческой тест-системы на основе ПЦР-РВ. В работе было показано, что одним из наиболее важных факторов, определяющих разнообразие вариантов ВКЭ, циркулирующего на границах ареала, является занос вирусов/клещей из других регионов. Локальные очаги ВКЭ могут значительно различаться по значимости этого фактора. На территории России широко распространены сегментированные флавиподобные вирусы (вирус Алонгшан и вирус Янггоу). Было показано существование сочетанных очагов ВКЭ и флавиподобных вирусов на территории России. В результате работы были получены полные нуклеотидные последовательности 4 геномов вируса Алонгшан и 1 генома вируса Янггоу, показана длительная персистентная инфекция в культурах клеток клещей Ixodes ricinus (IRE/CTVM19) и Hyalomma anatolicum (HAE/CTVM8), описана морфология вирионов вируса Алонгшан. По данным филогенетического анализа сегмента 2, кодирующего поверхностные структурные вирусные белки, показано, что основными факторами эволюции вируса являются вид основного переносчика, а также место изоляции вируса. Штаммы/ампликоны вируса Алонгшан при филогенетическом анализе разделяются в соответствии с основным видом переносчика на группы «I. ricinus» и «I. persulcatus». В свою очередь, группа «I. persulcatus» разделяется на европейскую и азиатскую подгрупп.
  Результаты работы полностью представлены в 7 статьях в рецензируемых научных изданиях, включенных в список ВАК.
chairman_dissertation_council.name: Айдар
chairman_dissertation_council.surname: Ишмухаметов
chairman_dissertation_council.patronymic: Айратович
chairman_dissertation_council.position: Генеральный директор
chairman_dissertation_council.degree: Доктор медицинских наук
chairman_dissertation_council.rank: Член-корреспондент РАН
chairman_dissertation_council.wos_research_id: L-4482-2018
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 57195034442
chairman_dissertation_council.rinc_id: 827684
chairman_dissertation_council.url: https://orcid.org/0000-0001-6130-4145
chairman_dissertation_council.orcid: 0000-0001-6130-4145
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Айдар
organization_supervisor.surname: Ишмухаметов
organization_supervisor.patronymic: Айратович
organization_supervisor.position: Генеральный директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.25.17
rubrics.name: Морфология и физиология вирусов
oecds.code: 01.06.ZE
oecds.name: VIROLOGY
speciality_codes.name: Вирусология
speciality_codes.code: 1.5.10.
supervisors.fio: Карганова Галина Григорьевна
supervisors.scientific_degree: Доктор биологических наук
supervisors.speciality_code: Вирусология
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Ларичев Виктор Филиппович
opponents.scientific_degree: Доктор медицинских наук
opponents.speciality_code: Вирусология
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Кюрегян Карен Каренович
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Вирусология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ФГАНУ "ФНЦИРИП ИМ. М.П. ЧУМАКОВА РАН" (ИНСТИТУТ ПОЛИОМИЕЛИТА)
protection_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ АВТОНОМНОЕ НАУЧНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ НАУЧНЫЙ ЦЕНТР ИССЛЕДОВАНИЙ И РАЗРАБОТКИ ИММУНОБИОЛОГИЧЕСКИХ ПРЕПАРАТОВ ИМ. М.П. ЧУМАКОВА РАН" (ИНСТИТУТ ПОЛИОМИЕЛИТА)
protection_organization.ogrn: 1167746624847
protection_organization.supervisor_name: АЙДАР
protection_organization.supervisor_surname: ИШМУХАМЕТОВ
protection_organization.supervisor_patronymic: АЙРАТОВИЧ
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные автономные учреждения
author_organization.short_name: ФГАНУ "ФНЦИРИП ИМ. М.П. ЧУМАКОВА РАН" (ИНСТИТУТ ПОЛИОМИЕЛИТА)
author_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ АВТОНОМНОЕ НАУЧНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ НАУЧНЫЙ ЦЕНТР ИССЛЕДОВАНИЙ И РАЗРАБОТКИ ИММУНОБИОЛОГИЧЕСКИХ ПРЕПАРАТОВ ИМ. М.П. ЧУМАКОВА РАН" (ИНСТИТУТ ПОЛИОМИЕЛИТА)
author_organization.ogrn: 1167746624847
author_organization.supervisor_name: АЙДАР
author_organization.supervisor_surname: ИШМУХАМЕТОВ
author_organization.supervisor_patronymic: АЙРАТОВИЧ
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные автономные учреждения