name: Таргетный масс-спектрометрический анализ фосфорилирования белков
keyword_list: Таргетная масс-спектрометрия Фосфорилирование Протеомика
abstract: Развитие количественных методов анализа фосфорилирования белков имеет большое научно-практическое значение, в частности для исследования механизмов развития патологий и разработки диагностических тестов. Диссертация посвящена разработке метода направленного анализа фосфоформ белков с использованием таргетной масс-спектрометрии и его применению для исследования фосфорилирования в биообразцах. Впервые автор применила фосфорилирование целевого белка in vitro для получения фосфопептидного шаблона для разработки, оптимизации и валидации таргетных методов масс-спектрометрии. Разработан и метрологически охарактеризован таргетный метод для фосфоформ основного белка миелина (МВР), с помощью которого впервые измерен уровень МВР и его фосфорилирования в биоптатах опухолей мозга и ликворе пациентов с опухолями мозга. Предложенный методический подход универсален и имеет перспективы применения в изучении процессов малигнизации, регуляции активности генов и внутриклеточной передачи сигнала.
  Диссертация выполнена в лаборатории системной биологии ФГБНУ «Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича». Научный руководитель – доктор биологических наук, профессор РАН Згода Виктор Гаврилович. Научный консультант – доктор физико-математических наук, профессор, член-корреспондент РАН Николаев Евгений Николаевич. Официальные оппоненты: доктор биологических наук, профессор Шишкин Сергей Сергеевич, доктор химических наук Смирнов Иван Витальевич. Ведущая организация – ФГБУН «Федеральный исследовательский центр питания, биотехнологии и безопасности пищи». Основные публикации: M.G. Zavialova и др. Is myelin basic protein a potential biomarker of brain cancer?  European Journal of Mass Spectrometry. – 2017. – V.23. — №4. – P.192-196; М.Г. Завьялова, В.Г. Згода, Е.Н. Николаев. Определение роли фосфорилирования белков в развитии заболеваний // Биомедицинская химия. – 2017. – T.63. - №2. - C.101-114
chairman_dissertation_council.name: Александр
chairman_dissertation_council.surname: Арчаков
chairman_dissertation_council.patronymic: Иванович
chairman_dissertation_council.position: Научный руководитель Института
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
chairman_dissertation_council.rank: Академик
chairman_dissertation_council.wos_research_id: B-5194-2012
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 36049531500; 57202449291
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Елена
organization_supervisor.surname: Пономаренко
organization_supervisor.patronymic: Александровна
organization_supervisor.position: Врио директора
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 31.27.31
rubrics.name: Биохимия опухолей
rubrics.code: 31.23.27
rubrics.name: Пептиды, белки
rubrics.code: 31.27.05
rubrics.name: Методы и аппаратура в биохимии
oecds.code: 03.01.QA
oecds.name: MEDICINE, RESEARCH & EXPERIMENTAL
oecds.code: 01.06.CQ
oecds.name: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
oecds.code: 01.06.CO
oecds.name: BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS
speciality_codes.name: Биохимия
speciality_codes.code: 03.01.04
supervisors.fio: Згода В.Г.
supervisors.scientific_degree: Доктор биологических наук
supervisors.speciality_code: Биохимия
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
supervisors.fio: Николаев Е.Н.
supervisors.scientific_degree: Доктор физико-математических наук
supervisors.speciality_code: Химическая физика, горение и взрыв, физика экстремальных состояний вещества
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Шишкин С.С.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Биохимия
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Смирнов И.В.
opponents.scientific_degree: Доктор химических наук
opponents.speciality_code: Биотехнология (в том числе бионанотехнологии)
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИБМХ
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича"
protection_organization.ogrn: 1027739053792
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ИБМХ
author_organization.name: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт биомедицинской химии имени В.Н. Ореховича"
author_organization.ogrn: 1027739053792
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения