name: Интегрированная информационно-компьютерная платформа для исследования молекулярно-генетических систем
keyword_list: Математическое моделирование, молекулярно-генетические системы, база данных, среда моделирования, меристема корня
abstract: Диссертационная работа представляет собой развитие модульной концепции моделирования молекулярно-генетических систем (МГС) на современной технической базе. Разработан интегральный комплекс из программ обеспечивающих разработку моделей, их генерацию, а также сохранение моделей целевых подсистем МГС для их повторного использования. Возможности интегрального комплекса показаны в исследованиях: бактериальных систем, стволовых клеток животных; меристемы побега и корня растения. В результате работы создана серия компьютерных математических моделей меристемы корня A. thaliana учитывающие разные размеры моделируемой области и мутанты по генам белков транспортерам ауксина. В исследовании показана важность ауксин-зависимого биосинтеза ключевых белков транспортёров ауксина и вклад каждого из них в поддержании работы ниши стволовых клеток меристемы, а также экспериментально подтверждён морфогенетический эффект низких концентраций экзогенной салициловой кислоты. Разработанные модели меристемы корня могут быть использованы в исследовании воздействий факторов внешней среды. Разработанная в рамках данной работы интегрированная информационно-компьютерная платформа может иметь широкое применение в исследованиях связанных с применением методов компьютерного и математического моделирования.
chairman_dissertation_council.surname: Рубцов Н.Б.
chairman_dissertation_council.position: зам. председателя
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
organization_supervisor.surname: Лаврюшев С.В.
organization_supervisor.position: зам. директора
rubrics.code: 34.05.25
rubrics.name: Методы и аппаратура для регистрации, обработки и хранения биологических данных
rubrics.code: 34.01.11
rubrics.name: Современное состояние и перспективы развития биологии
rubrics.code: 34.03.23
rubrics.name: Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
oecds.code: 01.06.MC
oecds.name: MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
oecds.code: 01.06.CU
oecds.name: BIOLOGY
speciality_codes.name: Математическая биология, биоинформатика
speciality_codes.code: 03.01.09
supervisors.fio: Лашин С.А.
supervisors.scientific_degree: Кандидат биологических наук
supervisors.speciality_code: Математическая биология, биоинформатика
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Щербаков Д.Ю.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Генетика
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Антонец Д.В.
opponents.scientific_degree: Кандидат биологических наук
opponents.speciality_code: Молекулярная биология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИЦиГ СО РАН
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»
protection_organization.ogrn: 1025403657410
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ИЦиГ СО РАН
author_organization.name: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Федеральный исследовательский центр Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук»
author_organization.ogrn: 1025403657410
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения