name: Интегративное моделирование структуры и динамики биомакромолекулярных комплексов
keyword_list: ДНК комплексы ДНК-белок молекулярная динамика футпринтинг хроматин интегративные подходы амилоидные фибриллы нуклеосомы молекулярное моделирование
abstract: Диссертационная работа посвящена разработке и применению методов интегративного моделирования для изучения структуры и динамики биомакромолекулярных комплексов. Разработаны интегративные подходы и программные решения для мультимасштабного моделирования комплексов ДНК, белков и пептидов, в которых используются как методы суперкомпьютерного моделирования методом молекулярной динамики, так и различные методы учета данных экспериментов ДНК футпринтинга, электронной микроскопии, FRET-микроскопии, рентгеновской дифракции, инфракрасной спектроскопии и спектроскопии кругового дихроизма, а также комбинированное представление ДНК в атомистическом и в динуклеотидном приближении. В работе изложены результаты по моделированию структуры и динамики нуклеосом, коровых частиц нуклеосом, комплексов нуклеосом с РНК-полимеразами, белками CENP-C, H1, комплексом FACT. В работе также изложены результаты по моделированию и определению структуры амилоидоподобных фибрилл, состоящих из пептидов или конъюгатов пептидов с синтетическими полимерами.
chairman_dissertation_council.name: Андрей
chairman_dissertation_council.surname: Рубин
chairman_dissertation_council.patronymic: Борисович
chairman_dissertation_council.position: Заведующий кафедрой
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
chairman_dissertation_council.rank: Член-корреспондент РАН
chairman_dissertation_council.wos_research_id: U-6451-2019
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 7402335852
chairman_dissertation_council.rinc_id: 895
chairman_dissertation_council.url: https://istina.msu.ru/profile/RubinAB/
chairman_dissertation_council.orcid: 0000-0001-8354-7965
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Михаил
organization_supervisor.surname: Кирпичников
organization_supervisor.patronymic: Петрович
organization_supervisor.position: Декан
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.15.15
rubrics.name: Пространственная структура и свойства биополимеров
rubrics.code: 34.03.23
rubrics.name: Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
rubrics.code: 34.17.03
rubrics.name: Теоретическая и математическая биофизика
oecds.code: 01.06.MC
oecds.name: MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY
oecds.code: 01.06.DA
oecds.name: BIOPHYSICS
speciality_codes.name: Математическая биология, биоинформатика
speciality_codes.code: 03.01.09
supervisors.fio: Кирпичников М.П.
supervisors.scientific_degree: Доктор биологических наук
supervisors.speciality_code: Молекулярная биология
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Разин С.В.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Молекулярная биология
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Ефремов Р.Г.
opponents.scientific_degree: Доктор физико-математических наук
opponents.speciality_code: Биофизика
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Бриллиантов Н.В.
opponents.scientific_degree: Доктор физико-математических наук
opponents.speciality_code: Теоретическая физика
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ М.В.ЛОМОНОСОВА, МГУ ИМЕНИ М.В.ЛОМОНОСОВА, МОСКОВСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИЛИ МГУ
protection_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ М.В.ЛОМОНОСОВА"
protection_organization.ogrn: 1037700258694
protection_organization.supervisor_name: ВИКТОР
protection_organization.supervisor_surname: САДОВНИЧИЙ
protection_organization.supervisor_patronymic: АНТОНОВИЧ
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ М.В.ЛОМОНОСОВА, МГУ ИМЕНИ М.В.ЛОМОНОСОВА, МОСКОВСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ ИЛИ МГУ
author_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ОБРАЗОВАНИЯ "МОСКОВСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ИМЕНИ М.В.ЛОМОНОСОВА"
author_organization.ogrn: 1037700258694
author_organization.supervisor_name: ВИКТОР
author_organization.supervisor_surname: САДОВНИЧИЙ
author_organization.supervisor_patronymic: АНТОНОВИЧ
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения