name: Лакказы и лигнинолитические пероксидазы дереворазрушающего гриба Trametes hirsuta: эволюция, транскрипция, секреция и участие в процессах биодеструкции
keyword_list: секреция транскрипция филогенетический анализ лакказа пероксидазы
abstract: Основной целью настоящей работы было исследование особенностей эволюционного формирования и участия в процессах биодеструкции лакказ и лигнинолитических пероксидаз гриба Trametes hirsuta. В рамках работы было установлено, что для T. hirsuta в состав мультигенного семейства лакказ входит семь полнофункциональных генов и один непроцессированный псевдоген, а в состав мультигенного семейств лигнинолитических пероксидаз – 18 полнофункциональных генов, из которых семь кодируют марганец пероксидазы, девять – лигнин пероксидазы, и два – версатил пероксидазы. На основе согласования деревьев, отражающих эволюцию генов лакказ и пероксидаз, с деревом, отражающим эволюцию грибов порядка Polyporales, в работе было предположено, что все гены лакказ T. hirsuta (как и других грибов Базовой полипороидной клады) произошли от одного предкового гена, наибольшее число дупликаций которого происходило в раннем Меловом периоде; в тоже время, все гены пероксидаз T. hirsuta (как и других грибов порядка Polyporales) произошли от восьми предковых генов, часть которых была потеряна к концу раннего Мелового периода, а оставшаяся часть претерпела обширные параллельные дупликации в более поздние периоды времени. В работе выявлены семь ортологических групп лакказ и 14 ортологических групп пероксидаз, включающих изоферменты T. hirsuta, и показано, что практически все лакказы, которые были описаны в литературе до сих пор, принадлежат к одной и той же ортологической группе (включающей изофермент LacA T. hirsuta). Было установлено, что для T. hirsuta при деградации сульфонфталеинового красителя бромкрезолового зеленого основными секретируемыми экзоферментами являются лакказа (LacA), а при деградации крафт-лигнина – пероксидазы (MnP5, VP2, MnP7 и MnP1). Также показано, что при культивировании T. hirsuta в присутствии бромкрезолового зеленого существенно снижается транскрипция всех генов пероксидаз, а в присутствии крафт-лигнина – большинства генов лакказ. Установлено, что под воздействием экзоферментов T. hirsuta происходит систематическая модификация молекулярного состава крафт-лигнина, при этом состав соединений, которые систематически модифицируются, значительно изменяется в зависимости от соотношения количества секретируемых грибом изоферментов пероксидаз.
chairman_dissertation_council.name: Владимир
chairman_dissertation_council.surname: Попов
chairman_dissertation_council.patronymic: Олегович
chairman_dissertation_council.position: научный руководитель Центра
chairman_dissertation_council.degree: Доктор химических наук
chairman_dissertation_council.rank: Академик
chairman_dissertation_council.wos_research_id: F-8810-2014
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 7404534215
chairman_dissertation_council.rinc_id: 80944
chairman_dissertation_council.orcid: 0000-0002-0133-7962
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Алексей
organization_supervisor.surname: Федоров
organization_supervisor.patronymic: Николаевич
organization_supervisor.position: и.о. директора
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 31.27.19
rubrics.name: Биохимия микроорганизмов
rubrics.code: 31.27.17
rubrics.name: Энзимология
rubrics.code: 34.15.23
rubrics.name: Молекулярная генетика
oecds.code: 01.06.CQ
oecds.name: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
speciality_codes.name: Биохимия
speciality_codes.code: 1.5.4.
supervisors.fio: Куликова Н.А.
supervisors.scientific_degree: Доктор биологических наук
supervisors.speciality_code: Экология
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Болотов И.Н.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Экология
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Лавров К..В.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Генетика
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ФИЦ БИОТЕХНОЛОГИИ РАН
protection_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР "ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ОСНОВЫ БИОТЕХНОЛОГИИ" РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК"
protection_organization.ogrn: 1037700131633
protection_organization.supervisor_name: АЛЕКСЕЙ
protection_organization.supervisor_surname: ФЕДОРОВ
protection_organization.supervisor_patronymic: НИКОЛАЕВИЧ
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ФИЦ БИОТЕХНОЛОГИИ РАН
author_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ФЕДЕРАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ЦЕНТР "ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ОСНОВЫ БИОТЕХНОЛОГИИ" РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК"
author_organization.ogrn: 1037700131633
author_organization.supervisor_name: АЛЕКСЕЙ
author_organization.supervisor_surname: ФЕДОРОВ
author_organization.supervisor_patronymic: НИКОЛАЕВИЧ
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения