name: Филогенетический анализ и дифференциация штаммов Yersinia pestis средневекового биовара
keyword_list: МИКРОБИОЛОГИЯ, ЧУМА, ШТАММЫ, ГЕНОМ, ПРИРОДНЫЙ ОЧАГ
abstract: Цель исследования - филогенетический анализ и разработка способов дифференциации штаммов Y. pestis средневекового биовара из природных очагов чумы Российской Федерации, стран СНГ и ближнего зарубежья. Определена современная популяционная структура штаммов Y. pestis средневекового биовара. Впервые установлены  принадлежность средневековых штаммов из очагов РФ и стран СНГ к филогенетической ветви 2.MED1, наличие в ней кавказско-каспийской и среднеазиатско-китайской ветвей. Разработаны способы: ПЦР типирования штаммов Y. pestis разных филогенетических ветвей; SNP-типирования штаммов из 5 очагов РФ. Создана база данных MLVA25 генотипов штаммов Y. pestis из 32 очагов стран СНГ. Разработан биоинформационный алгоритм анализа данных полногеномного секвенирования штаммов Y. pestis. Утверждены две методические рекомендации учрежденческого уровня. Область применения - определение филогенетической и природно-очаговой принадлежности штаммов Y. pestis средневекового биовара в противочумных учреждениях.
chairman_dissertation_council.surname: Кутырев В. В.
chairman_dissertation_council.position: директор
chairman_dissertation_council.degree: Доктор медицинских наук
organization_supervisor.surname: Кутырев В.В.
organization_supervisor.position: директор
organization_supervisor.degree: Доктор медицинских наук
rubrics.code: 76.03.43
rubrics.name: Медицинская микробиология
rubrics.code: 34.27.15
rubrics.name: Систематика и номенклатура микроорганизмов
rubrics.code: 39.25.19
rubrics.name: География болезней и их возбудителей
rubrics.code: 76.29.50
rubrics.name: Инфекционные болезни
rubrics.code: 76.33.43
rubrics.name: Эпидемиология
oecds.code: 01.06.QU
oecds.name: MICROBIOLOGY
speciality_codes.name: Микробиология
speciality_codes.code: 03.02.03
supervisors.fio: Ерошенко Г.А.
supervisors.scientific_degree: Доктор биологических наук
supervisors.speciality_code: Микробиология
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Кацы Е.И.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Микробиология
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Липницкий А.В.
opponents.scientific_degree: Доктор медицинских наук
opponents.speciality_code: Микробиология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ФКУЗ «РосНИПЧИ «Микроб» Роспотребнадзора
protection_organization.name: Федеральное казенное учреждение здравоохранения «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
protection_organization.ogrn: 1026402676112
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
protection_organization.okopf: Федеральные государственные казенные учреждения
author_organization.short_name: ФКУЗ «РосНИПЧИ «Микроб» Роспотребнадзора
author_organization.name: Федеральное казенное учреждение здравоохранения «Российский научно-исследовательский противочумный институт «Микроб» Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
author_organization.ogrn: 1026402676112
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека
author_organization.okopf: Федеральные государственные казенные учреждения