name: Транскриптомные нарушения, ассоциированные с прогрессированием рака предстательной железы
keyword_list: микроРНК мРНК экспрессия генов маркеры рак предстательной железы
abstract: В данной работе впервые проведен комплексный биоинформатический анализ траскриптомных профилей продвинутых стадий РПЖ на основе RNA-Seq и miRNA-Seq данных. Собрана уникальная коллекция из 80 образцов плазмы крови, полученных в течение продолжительной противоопухолевой терапии при КРРПЖ. Идентифицированы изменения транскриптомных профилей (мРНК и микроРНК), а также ключевые биологические пути, ассоциированные с лимфогенной диссеминацией, при мрРПЖ.
  Впервые показано статистически значимое изменение экспрессии генов OCLN, CST2, TBX1, F5, PCAT4, RAB27A, VGLL3, а также микроРНК miR-148a-3p и miR-615-3p при лимфогенной диссеминации мрРПЖ. Для генов OCLN, CST2 и PCAT4 и микроРНК miR-148a-3p и miR-615-3p подтверждена статистически значимая ассоциация уровня экспрессии с наличием лимфогенной диссеминации на независимой выборке образцов мрРПЖ. Идентифицированы модели, имеющие высокий прогностический потенциал для оценки агрессивности РПЖ – OCLN+PCAT4, miR-615-3p+miR-148a-3p, OCLN+PCAT4+miR-615-3p+miR-148a-3p.
  Также в данной работе впервые проведено высокопроизводительное секвенирование экзосомальных микроРНК для образцов плазмы крови пациентов с КРРПЖ, на основе которого идентифицированы 20 микроРНК, ассоциированных с прогрессией заболевания на фоне противоопухолевой терапии, и выявлены ключевые сигнальные пути.
  Полученные результаты вносят значительный вклад в понимание молекулярных механизмов лимфогенной диссеминации при мрРПЖ и прогрессии КРРПЖ. Предложены прогностические модели на основе экспрессии мРНК и микроРНК для идентификации лимфогенного метастазирования при мрРПЖ, которые могут быть использованы для разработки прогностической панели для уточнения прогноза пациента и выбора соответствующего терапевтического подхода: «OCLN+PCAT4» (AUC=0.74-0.76), «miR-615-3p+miR-148a-3p» (AUC=0.76-0.77), «OCLN+PCAT4+miR-615-3p+miR-148a-3p» (AUC= 0.83-0.86). Полученные данные профилирования экзосомальных микроРНК плазмы крови пациентов с КРРПЖ, могут быть использованы для поиска перспективных предиктивных маркеров заболевания.
chairman_dissertation_council.name: Сергей
chairman_dissertation_council.surname: Кочетков
chairman_dissertation_council.patronymic: Николаевич
chairman_dissertation_council.position: главный научный сотрудник
chairman_dissertation_council.degree: Доктор химических наук
chairman_dissertation_council.rank: Академик
chairman_dissertation_council.wos_research_id: O-1065-2013
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 7006711268
chairman_dissertation_council.rinc_id: 820
chairman_dissertation_council.orcid: 0000-0002-7443-6961
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: София
organization_supervisor.surname: Георгиева
organization_supervisor.patronymic: Георгиевна
organization_supervisor.position: директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.15.51
rubrics.name: Молекулярная онкология
oecds.code: 01.06.CQ
oecds.name: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
speciality_codes.name: Молекулярная биология
speciality_codes.code: 03.01.03
supervisors.fio: Кудрявцева А.В.
supervisors.scientific_degree: Кандидат биологических наук
supervisors.speciality_code: Молекулярная биология
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Орлов Ю.Л.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Математическая биология, биоинформатика
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИМБ РАН
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук
protection_organization.ogrn: 1037736018066
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ИМБ РАН
author_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук
author_organization.ogrn: 1037736018066
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения