name: Влияние поверхностных консервативных аминокислот на активность антирестриктазы ArdB (R64)
keyword_list: РЕСТРИКЦИЯ, АНТИРЕСТРИКЦИЯ, АНТИРЕСТРИКТАЗЫ, ARDB, КОНЪЮГАТИВНЫЕ ПЛАЗМИДЫ
abstract: Антирестрикционные белки семейства ArdB специфически ингибируют рестрикционнную активность систем рестрикции - модификации типа I. Цель: анализ влияния консервативных аминокислот на антирестрикционную активность ArdB. В качестве модельного гена используется ardB из трансмиссивной плазмиды R64 (группа несовместимости IncI1). Анализ полученных мутантных форм ArdB выявил наличие на поверхности белковой глобулы консервативных аминокислот, существенных для антирестрикционной активности. Исследуемые поверхностные аминокислоты отобраны с помощью биоинформатического анализа как аминокислоты, не влияющие на трехмерную структуру белка. Показана ключевая роль С-концевого аспартата (D141) для проявления антирестрикционной активности ArdB. Отсутствие этой заряженной аминокислоты полностью снимает активность. Показано, что при выделении методами аффинной и ионообменной хроматографии с нативным белком ArdB совыделяется c ДНК. Установлено, что при выделении мутантного варианта (ΔD141) совыделения с ДНК не происходит. Полученные данные позволили выдвинуть гипотезу о механизме работы антирестриктазы ArdB, связанную с блокированием транслокации ДНК через R-субъединицу комплекса рестрикции модификации I типа.
chairman_dissertation_council.surname: Чупин В.В.
chairman_dissertation_council.position: главный научный сотрудник
chairman_dissertation_council.degree: Доктор химических наук
organization_supervisor.surname: Кудрявцев Н. Н.
organization_supervisor.position: ректор
organization_supervisor.degree: Доктор физико-математических наук
rubrics.code: 34.15.23
rubrics.name: Молекулярная генетика
oecds.code: 01.06.CQ
oecds.name: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
speciality_codes.name: Биофизика
speciality_codes.code: 03.01.02
supervisors.fio: Манухов И.В.
supervisors.scientific_degree: Доктор биологических наук
supervisors.speciality_code: Генетика
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: -
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: -
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: МФТИ
protection_organization.name: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Московский физико-технический институт (национальный исследовательский  университет)"
protection_organization.ogrn: 1027739386135
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные автономные учреждения
author_organization.short_name: МФТИ
author_organization.name: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Московский физико-технический институт (национальный исследовательский  университет)"
author_organization.ogrn: 1027739386135
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные автономные учреждения