name: Идентификация молекулярно-генетических нарушений каротидных параганглиом
keyword_list: каротидные параганглиомы экзом секвенирование транскриптом NGS мутационная нагрузка
abstract: Каротидные параганглиомы (КПГ) являются редкими нейроэндокринными опухолями головы и шеи с вариабельным потенциалом метастазирования. Проведено исследование молекулярно-генетических нарушений КПГ, ассоциированных с их образованием и прогрессией, на основе анализа «omics»-данных. Идентифицировано 34 гена, характеризующихся высокой частотой мутаций при КПГ. Эти гены главным образом вовлечены в метаболические пути, дифференцировку, адгезию, рост и миграцию клеток, иммунный ответ. Ряд генов ассоциирован с канцерогенезом. Выявлено 3 гена (MYH15, CSP1 и MYH3), мутации, приводящие к потери функции белка, в которых нарушают их экспрессию при КПГ. Участие этих генов в патогенезе КПГ показано впервые. Идентифицирован список патогенных и потенциально патогенных герминальных мутаций в генах SDHB, SDHC, SDHD и RET, а также соматических мутаций в генах TP53, SDHD, JAG1, PRDM2, PRDM8, SETD2, ASPM, ZIC, GRIK1 и других, которые выявлены в исследуемой выборке образцов КПГ, полученных от пациентов российской популяции. Описаны молекулярные пути с участием генов SARM1, DISC1, CTDSP2, IGFBP2 и CPS1, которые могут быть вовлечены в развитие КПГ. Разработан алгоритм оценки мутационной нагрузки для опухолей с низкой частотой мутаций. Значение мутационной нагрузки для КПГ составляет 0,09 - 0,28 на 1 мегабазу кодирующих областей и сайтов сплайсинга. КПГ являются опухолями с низким уровнем мутационной нагрузки.
chairman_dissertation_council.surname: Кочетков С. Н.
chairman_dissertation_council.position: главный научный сотрудник
chairman_dissertation_council.degree: Доктор химических наук
organization_supervisor.surname: Макаров А. А.
organization_supervisor.position: Директор
organization_supervisor.degree: Доктор биологических наук
rubrics.code: 34.15.23
rubrics.name: Молекулярная генетика
rubrics.code: 34.03.23
rubrics.name: Математическая биология и теоретическое моделирование биологических процессов. Биоинформатика
rubrics.code: 34.15.51
rubrics.name: Молекулярная онкология
oecds.code: 01.06.00
oecds.name: Biological sciences
oecds.code: 03.02.DM
oecds.name: ONCOLOGY
oecds.code: 03.03.PT
oecds.name: MEDICAL INFORMATICS
speciality_codes.name: Молекулярная биология
speciality_codes.code: 03.01.03
supervisors.fio: Снежкина Анастасия Владимировна
supervisors.scientific_degree: Кандидат биологических наук
supervisors.speciality_code: Молекулярная биология
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Гуляева Людмила Федоровна
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Молекулярная биология
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Мамедов Ильгар Зияддинович
opponents.scientific_degree: Кандидат биологических наук
opponents.speciality_code: Молекулярная биология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИМБ РАН
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук
protection_organization.ogrn: 1037736018066
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ИМБ РАН
author_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт молекулярной биологии им. В.А. Энгельгардта Российской академии наук
author_organization.ogrn: 1037736018066
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения