name: АССОЦИАЦИИ ПОЛИМОРФИЗМА ГЕНОВ CDKN2B-AS1 И LOXL1 С РАЗВИТИЕМ ПЕРВИЧНОЙ ОТКРЫТОУГОЛЬНОЙ ГЛАУКОМЫ У НАСЕЛЕНИЯ ЦЕНТРАЛЬНОГО ЧЕРНОЗЕМЬЯ РОССИИ
keyword_list: гены глаукома LOXL1, CDKN2B-AS1 полиморфизм ассоциации первичная открытоугольная глаукома
abstract: Цель исследования – провести репликативное исследование ассоциаций GWAS-значимых для первичной открытоугольной глаукомы полиморфных локусов генов CDKN2B-AS1 и LOXL1 у населения Центрального Черноземья России.  
  Реплицированы ассоциации восьми GWAS-значимых полиморфных локусов генов LOXL1 (rs2165241, rs4886776, rs893818) и CDKN2B-AS1 (rs1063192, rs7865618, rs2157719, rs944800, rs4977756) с ПОУГ у населения Центрального Черноземья России: с развитием заболевания связаны самостоятельно 3 SNPs, в составе гаплотипов – 5 SNPs, в наиболее значимых моделях SNP×SNP взаимодействий – 7 SNPs. 
  Полиморфизм rs2165241 гена LOXL1 ассоциирован с развитием ПОУГ на полногеномном уровне значимости (аддитивная модель OR=0,46, 95%Сl 0,37-0,58, р=1,53*10-11, рperm=1,00*10-6). Аллели А rs4886776 и rs893818 гена LOXL1 связаны с низким риском возникновения заболевания (OR=0,36-0,63).
  Гаплотип TGG гаплоблока rs2165241-rs4886776-rs893818 гена LOXL1 является фактором риска развития ПОУГ (OR=2,17, р=1,58*10-11, рperm=0,001), а гаплотип CAA этого гаплоблока имеет протективное значение (OR=0,59, p=0,0003, рperm=0,001). 
  Наиболее значимая шестилокусная модель SNP×SNP взаимодействий, ассоциированная с ПОУГ, включает шесть локусов rs2165241 LOXL1 х rs893818 LOXL1 х rs1063192 CDKN2B-AS1 х rs7865618 CDKN2B-AS1 х rs2157719 CDKN2B-AS1 х rs4977756 CDKN2B-AS1 (WL=38,93, р=4,4*10-10, рperm≤0,001).
  Полиморфные локусы генов CDKN2B-AS1 и LOXL1 равнозначно вовлечены в формирование ПОУГ у женщин и мужчин.
  SNP×SNP взаимодействия GWAS-значимых для ПОУГ генов CDKN2B-AS1 (rs7865618, rs2157719, rs944800, rs4977756), LOXL1 (rs2165241, rs4886776) и генов матриксных металлопротеиназ - MMP9 (rs17576, rs3787268, rs2250889, rs17577), MMP3 (rs679620), MMP1 (rs1799750), ассоциированы с развитием заболевания в рамках 6 наиболее значимых моделей межгенных взаимодействий (рperm≤0,001).
  Гены-кандидаты ПОУГ (CDKN2B-AS1, LOXL1, LOXL1-AS1, CDKN2B, CDKN2A, RP11-24D15.1, RP11-149I2.4, RP11-941F15.1, RP11-145E5.5) реализуют свои фенотипические эффекты через биологические пути, связанные с регуляцией активности циклин-зависимых серин-треониновых киназ, клеточным циклом (G1 фаза, p53) и процессами, опосредованными старением (оксидативный стресс, клеточное старение, эффекты онкогенов, секреторный фенотип SASP) (Fold Enrichment > 100, pFDR≤0,05).
chairman_dissertation_council.name: Михаил
chairman_dissertation_council.surname: Чурносов
chairman_dissertation_council.patronymic: Иванович
chairman_dissertation_council.position: заведующий кафедрой медико-биологических
chairman_dissertation_council.degree: Доктор медицинских наук
chairman_dissertation_council.rank: Профессор
chairman_dissertation_council.wos_research_id: W-1313-2017
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 6601948788
chairman_dissertation_council.rinc_id: 117360
chairman_dissertation_council.url: https://orcid.org/0000-0003-1254-6134
chairman_dissertation_council.orcid: 0000-0003-1254-6134
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Николай
organization_supervisor.surname: Репников
organization_supervisor.patronymic: Иванович
organization_supervisor.position: проректор по науке и инновациям
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 76.03.39
rubrics.name: Медицинская генетика. Медико-генетическое консультирование
oecds.code: 01.06.KM
oecds.name: GENETICS & HEREDITY
speciality_codes.name: Генетика
speciality_codes.code: 03.02.07
supervisors.fio: Чурносов М.И.
supervisors.scientific_degree: Доктор медицинских наук
supervisors.speciality_code: Генетика
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
protection_organization.short_name: ФГАОУ ВО "Белгородский государственный национальный исследовательский университет", НИУ "БелГУ"
protection_organization.name: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Белгородский государственный национальный исследовательский университет"
protection_organization.ogrn: 1023101664519
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные автономные учреждения
author_organization.short_name: ФГАОУ ВО "Белгородский государственный национальный исследовательский университет", НИУ "БелГУ"
author_organization.name: Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего образования "Белгородский государственный национальный исследовательский университет"
author_organization.ogrn: 1023101664519
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные автономные учреждения