name: Экспрессия микроРНК и метилирование ДНК в атеросклеротических бляшках сонных артерий
keyword_list: атеросклеротические бляшки сонных артерий эпигенетика генетический полиморфизм атеросклероз метилирование ДНК микроРНК
abstract: Объект исследования: Образцы ДНК, выделенные из лейкоцитов периферической крови полученной от пациентов с атеросклерозом сонных артерий (n=121) и относительно здоровых индивидов в отношении сердечно-сосудистой патологии (n=72). А также образцы ДНК и РНК, выделенные из биоптатов поражённой атеросклерозом сонной артерии (n=21) и подлежащая относительно интактная часть ткани (n=5), полученных от пациентов в ходе проведения плановой каротидной эндартерэктомии.
  Цель работы: Выявление особенностей эпигенетических модификаций в клетках атеросклеротических бляшек сонных артерий у пациентов с клинически выраженным атеросклерозом на основе интегративного анализа экспрессии микроРНК, метилирования ДНК и генетического полиморфизма.
  Методы: В работе использованы современные методы молекулярно-генетического, статистического и биоинформатического анализа, а также методы клинического и параклинического обследования пациентов, гистологического анализа тканей артерий. Молекулярно-генетические методы включали секвенирование микроРНК, гибридизацию на биологических микрочипах, экзомное секвенирование и ПЦР-ПДРФ анализ. В ходе выполнения диссертационной работы использован широкий спектр методов биоинформационного и статистического анализа данных, реализованных в программной статистической среде R/Bioconductor.
  Теоретическая и практическая значимость: Полученные в ходе выполнения диссертационного исследования новые знания расширяют представление о спектре экспрессируемых в атеросклеротических бляшках микроРНК, полиморфных вариантах в их структуре, а также их связи с метилированием ДНК и клеточным составом. Сформированные в результате исследования списки дифференциально-экспрессированных микроРНК и дифференциально-метилированных CpG-сайтов между интактными сонными артериями и атеросклеротическими бляшками с высокой и низкой лейкоцитарной инфильтрацией представляют интерес для дальнейшего изучения на предмет выделения потенциальных биомаркёров и мишеней для лечения атеросклероза сонных артерий. Разработанные подходы для деконволюции клеточного состава артериальной стенки с использованием данных об уровне метилирования ДНК и экспрессии микроРНК могут быть адаптированы для применения при проведении других исследований, затрагивающих не только атеросклероз, но и другие патологии, особенно в случае высокой клеточной гетерогенности образцов тканей. Созданный алгоритм для обработки данных микроРНК секвенирования с последующим точным извлечением информации о полиморфизмах в их структуре может быть использован для получения нового уровня данных при проведении экспериментов по секвенированию микроРНК.
chairman_dissertation_council.name: Валерий
chairman_dissertation_council.surname: Пузырев
chairman_dissertation_council.patronymic: Павлович
chairman_dissertation_council.position: научный руководитель
chairman_dissertation_council.degree: Доктор медицинских наук
chairman_dissertation_council.rank: Академик
chairman_dissertation_council.wos_research_id: S-3144-2016
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 7005619584
chairman_dissertation_council.rinc_id: 108193
chairman_dissertation_council.url: https://www.tnimc.ru/kontakty/personalii/tnimc/puzyrev-valeriy-pavlovich/
chairman_dissertation_council.orcid: 0000-0002-2113-4556
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Вадим
organization_supervisor.surname: Степанов
organization_supervisor.patronymic: Анатольевич
organization_supervisor.position: Директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 76.03.39
rubrics.name: Медицинская генетика. Медико-генетическое консультирование
oecds.code: 01.06.KM
oecds.name: GENETICS & HEREDITY
speciality_codes.name: Генетика
speciality_codes.code: 1.5.7.
supervisors.fio: Назаренко М.С.
supervisors.scientific_degree: Доктор медицинских наук
supervisors.speciality_code: Генетика
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Чурносов М.И.
opponents.scientific_degree: Доктор медицинских наук
opponents.speciality_code: Генетика
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Шахтшнейдер Е.В.
opponents.scientific_degree: Кандидат медицинских наук
opponents.speciality_code: Генетика
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ТОМСКИЙ НИМЦ
protection_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ НАУЧНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ТОМСКИЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ МЕДИЦИНСКИЙ ЦЕНТР РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК"
protection_organization.ogrn: 1027000861568
protection_organization.supervisor_name: ВАДИМ
protection_organization.supervisor_surname: СТЕПАНОВ
protection_organization.supervisor_patronymic: АНАТОЛЬЕВИЧ
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ТОМСКИЙ НИМЦ
author_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ НАУЧНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ "ТОМСКИЙ НАЦИОНАЛЬНЫЙ ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ МЕДИЦИНСКИЙ ЦЕНТР РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК"
author_organization.ogrn: 1027000861568
author_organization.supervisor_name: ВАДИМ
author_organization.supervisor_surname: СТЕПАНОВ
author_organization.supervisor_patronymic: АНАТОЛЬЕВИЧ
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения