name: Разработка эффективных методов конструирования бесплазмидных рекомбинантных штаммов коринебактерий на основе элементов бактериофагов
keyword_list: RecET-опосредованная рекомбинация (Int/Xis) φ16 и Cre/lox сайт-специфические системы рекомбинации коринефаги φ673, φ674 и φ16 Corynebacterium glutamicum
abstract: Диссертационная работа Лобановой Ю.С. посвящена поиску новых генетических элементов бактериофагов, а так же разработке нового генно-инженерного подхода направленной модификации генома C. glutamicum для создания безмаркерных бесплазмидных рекомбинантных штаммов.
  Впервые два вирулентных фага φ673, φ674 C. glutamicum ATCC 13032 и  умеренный бактериофаг φ16 C. glutamicum ATCC 21792 были охарактеризованы морфологически, а их геномы впервые полностью секвенированы и аннотированы. Также, был разработан генно-инженерный инструментарий на основе сайт-специфической системы рекомбинации фага φ16 для интеграции целевых генов в хромосому. Была доказана способность укороченного варианта экзонуклеазы RecE564 совместно с полноразмерной рекомбиназой RecT Rac профага E. coli осуществлять рекомбинацию между дц линейным фрагментом ДНК и кольцевой хромосомой С. glutamicum. Была впервые продемонстрирована возможность переноса маркированных модификаций методом электротрансформации геномной ДНК в C. glutamicum. Было так же установлено, что эффективность переноса модификаций, может быть существенно увеличена в условиях RecE564T экспрессии. Отдельные генно-инженерные инструменты на основе RecE564T-зависимой гомологичной и двух сайт-специфических систем рекомбинации коринефага φ16 и Cre/lox фага P1 были объединены в стратегию Dual-In/Out для конструирования безмаркерного рекомбинантного штамма C. glutamicum. Применение разработанного метода было продемонстрировано для двух промышленно значимых штаммов  C. glutamicum ATCC 13032 и ATCC 13869.
chairman_dissertation_council.name: Илья
chairman_dissertation_council.surname: Захаров-Гезехус
chairman_dissertation_council.patronymic: Артемьевич
chairman_dissertation_council.position: главный научный сотрудник
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
chairman_dissertation_council.rank: Член-корреспондент РАН
chairman_dissertation_council.wos_research_id: -
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 7202049481
chairman_dissertation_council.rinc_id: 74979
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Александр
organization_supervisor.surname: Кудрявцев
organization_supervisor.patronymic: Михайлович
organization_supervisor.position: директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.27.21
rubrics.name: Генетика и селекция микроорганизмов
rubrics.code: 34.23.17
rubrics.name: Биохимическая генетика
rubrics.code: 34.15.27
rubrics.name: Генетическая инженерия
rubrics.code: 34.15.23
rubrics.name: Молекулярная генетика
oecds.code: 01.06.KM
oecds.name: GENETICS & HEREDITY
oecds.code: 02.08.DB
oecds.name: BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY
oecds.code: 01.06.ZE
oecds.name: VIROLOGY
oecds.code: 01.06.QU
oecds.name: MICROBIOLOGY
oecds.code: 01.06.CQ
oecds.name: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
speciality_codes.name: Генетика
speciality_codes.code: 1.5.7.
supervisors.fio: Горшкова Н.В.
supervisors.scientific_degree: Кандидат биологических наук
supervisors.speciality_code: Молекулярная биология
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Каратаев Г.И.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Генетика
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Яненко А.С.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Генетика
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИОГЕН РАН
protection_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ ИНСТИТУТ ОБЩЕЙ ГЕНЕТИКИ ИМ. Н.И. ВАВИЛОВА РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК
protection_organization.ogrn: 1037739549748
protection_organization.supervisor_name: АЛЕКСАНДР
protection_organization.supervisor_surname: КУДРЯВЦЕВ
protection_organization.supervisor_patronymic: МИХАЙЛОВИЧ
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ЗАО "АГРИ"
author_organization.name: Закрытое акционерное общество "Научно-исследовательский институт Аджиномото-Генетика"
author_organization.ogrn: 1037739522006
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Федеральная налоговая служба
author_organization.okopf: Непубличные акционерные общества