name: Маркеры метилирования ДНК в оценке ответа на неоадъювантную химиотерапию при раке молочной железы
keyword_list: метод XmaI-RRBS метод МЧ-кПЦР рак молочной железы предиктивные маркеры метилирование ДНК неоадъювантная химиотерапия
abstract: На разведочной выборке биопсийного материала, взятого до лечения (n=73), опухолей ТН и люм.B подтипов, проведен широкогеномный поиск маркеров метилирования ДНК в группах опухолей, чувствительных и устойчивых к НАХТ, и выявлены дифференциально метилированные участки опухолевого генома, различающие эти группы. Разработан метод многолокусной метилчувствительной количественной ПЦР, позволяющий мультиплексировать несколько таргетных и контрольные геномные локусы в одной реакции. Проведена оценка диагностической ценности маркёров метилирования на дополнительной выборке (n=83). Сформированы тест-системы из маркеров метилирования для формирования классификатора ответа на НАХТ при РМЖ: cvAUC=0,83; (панель генов TMEM132D и MYO15B, с чувствительностью и специфичностью 0,76 для ТН РМЖ), а для группы люм.B РМЖ – cvAUC=0,76; (панель генов TTC34, LTBR, CLEC14A, с чувствительностью 0,7 и специфичностью 0,79). Показана возможность использования эпигенетических классификаторов вкупе с клинико-морфологическими показателями для повышения диагностической ценности маркеров метилирования ДНК в оценке ответа на НАХТ при РМЖ
chairman_dissertation_council.name: Евгений
chairman_dissertation_council.surname: Гинтер
chairman_dissertation_council.patronymic: Константинович
chairman_dissertation_council.position: научный руководитель центра
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
chairman_dissertation_council.rank: Академик
chairman_dissertation_council.wos_research_id: B-2287-2016
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 7103183365
chairman_dissertation_council.rinc_id: 755
chairman_dissertation_council.orcid: 0000-0001-6920-6726
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Сергей
organization_supervisor.surname: Куцев
organization_supervisor.patronymic: Иванович
organization_supervisor.position: директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.15.51
rubrics.name: Молекулярная онкология
rubrics.code: 34.15.25
rubrics.name: Молекулярная биология гена
rubrics.code: 34.15.23
rubrics.name: Молекулярная генетика
oecds.code: 01.06.KM
oecds.name: GENETICS & HEREDITY
speciality_codes.name: Генетика
speciality_codes.code: 03.02.07
supervisors.fio: Танас А.С.
supervisors.scientific_degree: Кандидат биологических наук
supervisors.speciality_code: Генетика
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Поспехова Н.И.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Генетика
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Когония Л.М.
opponents.scientific_degree: Доктор медицинских наук
opponents.speciality_code: Онкология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ФГБНУ «МГНЦ»
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова»
protection_organization.ogrn: 1027739609480
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ФГБНУ «МГНЦ»
author_organization.name: Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Медико-генетический научный центр имени академика Н.П. Бочкова»
author_organization.ogrn: 1027739609480
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения