name: Закономерности процесса удаления объёмных аддуктов из кластерных повреждений ДНК системой NER млекопитающих
keyword_list: репарация ДНК объемные аддукты NER
abstract: Эксцизионная репарация нуклеотидов является основным механизмом удаления объемных повреждений, существенно искажающих структуру ДНК-спирали. Повреждения, процессируемые NER, возникают в результате воздействия на ДНК живой клетки ультрафиолетового (УФ) и ионизирующего излучения, химиотерапевтических агентов, а также различных канцерогенов окружающей среды. Система NER в клетках эукариот играет важную роль в поддержании стабильности генома. Накопление повреждений ДНК является одной из причин развития онкологических заболеваний и связано с преждевременным старением. С другой стороны, высокая эффективность репарации аддуктов некоторых химиотерапевтических препаратов с ДНК в процессе NER может приводить к резистентности к ним раковых клеток.
  Два или более повреждений, расположенных в пределах одного-двух витков спирали ДНК, называют кластерными. Кластеры, состоящие из повреждений различной структуры, могут возникать в ДНК при интенсивном комбинированном воздействии повреждающих факторов.
  Целью данной работы являлось исследование свойств ДНК, содержащих кластерные повреждения, как субстратов для системы NER, определение зависимости между типом и расположением повреждений ДНК в кластере и эффективностью их распознавания и последующей эксцизии в процессе NER, а также выявление структурных свойств, которые лежат в основе устойчивости повреждений ДНК к эксцизии, катализируемой системой NER.
   В данной работе исследован процесс распознавания и удаления из ДНК объемных аддуктов, входящих в состав кластеров повреждений, белками системы NER. Проведен систематический анализ свойств модельных ДНК, содержащих кластерные повреждения, в том числе оценена эффективность протекания ключевых этапов NER – первичного узнавания поврежденного участка ДНК комплексом белков XPC и RAD23B, и эксцизии объемного повреждения ДНК белками системы NER in vitro. Благодаря данным компьютерного моделирования выявлены структурные особенности, характерные для устойчивых к репарации ДНК, содержащих кластерные повреждения.
chairman_dissertation_council.name: Дмитрий
chairman_dissertation_council.surname: Пышный
chairman_dissertation_council.patronymic: Владимирович
chairman_dissertation_council.position: директор
chairman_dissertation_council.degree: Доктор химических наук
chairman_dissertation_council.rank: Член-корреспондент РАН
chairman_dissertation_council.wos_research_id: F-4729-2013
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 7006677629
chairman_dissertation_council.orcid: 0000-0002-2587-3719
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Дмитрий
organization_supervisor.surname: Пышный
organization_supervisor.patronymic: Владимирович
organization_supervisor.position: директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.15.17
rubrics.name: Макромолекулярные ассоциации и проблемы узнавания в молекулярной биологии
oecds.code: 01.06.DA
oecds.name: BIOPHYSICS
oecds.code: 01.06.CU
oecds.name: BIOLOGY
oecds.code: 01.06.CO
oecds.name: BIOCHEMICAL RESEARCH METHODS
oecds.code: 01.06.CQ
oecds.name: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
speciality_codes.name: Биохимия
speciality_codes.code: 03.01.04
supervisors.fio: Лаврик О. И.
supervisors.scientific_degree: Доктор химических наук
supervisors.speciality_code: Биоорганическая химия
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
supervisors.fio: Петрусева И. О.
supervisors.scientific_degree: Кандидат химических наук
supervisors.speciality_code: Биохимия
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Трифонов В. А.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Клеточная биология, цитология, гистология
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Малыгин А. А.
opponents.scientific_degree: Доктор химических наук
opponents.speciality_code: Биохимия
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Савинкова Л. К.
opponents.scientific_degree: Кандидат биологических наук
opponents.speciality_code: Клеточная биология, цитология, гистология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИХБФМ СО РАН
protection_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ ИНСТИТУТ ХИМИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ И ФУНДАМЕНТАЛЬНОЙ МЕДИЦИНЫ СИБИРСКОГО ОТДЕЛЕНИЯ РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК
protection_organization.ogrn: 1025403659852
protection_organization.supervisor_name: ДМИТРИЙ
protection_organization.supervisor_surname: ПЫШНЫЙ
protection_organization.supervisor_patronymic: ВЛАДИМИРОВИЧ
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ИХБФМ СО РАН
author_organization.name: ФЕДЕРАЛЬНОЕ ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ НАУКИ ИНСТИТУТ ХИМИЧЕСКОЙ БИОЛОГИИ И ФУНДАМЕНТАЛЬНОЙ МЕДИЦИНЫ СИБИРСКОГО ОТДЕЛЕНИЯ РОССИЙСКОЙ АКАДЕМИИ НАУК
author_organization.ogrn: 1025403659852
author_organization.supervisor_name: ДМИТРИЙ
author_organization.supervisor_surname: ПЫШНЫЙ
author_organization.supervisor_patronymic: ВЛАДИМИРОВИЧ
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения