name: Возрастные изменения в структуре репертуаров Т-клеточных рецепторов наивных Т-лимфоцитов
keyword_list: АДАПТИВНЫЙ ИММУНИТЕТ, Т-ЛИМФОЦИТ, Т-КЛЕТКА, РЕПЕРТУАР Т-КЛЕТОК, НАИВНЫЕ Т-КЛЕТКИ, Т-КЛЕТОЧНЫЙ РЕЦЕПТОР, CDR3, РАЗНООБРАЗИЕ Т-КЛЕТОЧНЫХ РЕПЕРТУАРОВ, ВОЗРАСТНЫЕ ИЗМЕНЕНИЯ В СТРУКТУРЕ РЕПЕРТУАРА Т-ЛИМФОЦИТОВ,  CD4 Т-КЛЕТКИ, CD8 Т-КЛЕТКИ, RTE,  КДНК БИБЛИОТЕКИ ГЕНОВ Т-КЛЕТОЧНЫХ РЕЦЕПТОРОВ, ВЫСОКОПРОИЗВОДИТЕЛЬНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ
abstract: На основе технологии 5"-RACE и молекулярного баркодирования (UMI) разработан метод анализа репертуаров Т-клеточных рецепторов, позволяющий работать в том числе и с небольшими стартовыми количествами клеток. С применением разработанного метода  продемонстрирована возможность предсказания нативных пар αβ-цепей Т-клеточных рецепторов. Проанализированы тотальные TCRβ- репертуары периферической крови доноров разного возраста и образцов пуповинной крови (UCB). Отсортированы и проанализированы репертуары наивных CD4 и CD8 Т-лимфоцитов доноров разного возраста, и показаны возрастные изменения в структуре репертуаров наивных CD4 Т-лимфоцитов, недавних эмигрантов тимуса (RTE) и зрелых наивных CD4 Т-клеток: наблюдаются изменения базовых характеристик CDR3-репертуаров (средняя длина CDR3-региона, размер вставки NDN и количество N нуклеотидов), а также биофизических свойств (аффинность к рМНС, полярность и гидрофобность) аминокислотных остатков в центральной части CDR3-региона, непосредственно принимающих участие в распознавании молекулы презентируемого антигена. Наблюдаемые изменения в пуле наивных CD4 Т-клеток затрагивают как субпопуляцию недавних эмигрантов из тимуса (RTE), так и зрелых наивных клеток и не зависят от падения доли RTE с возрастом или изменения соотношения CD31⁺/CD31⁻ клеток в целом.
chairman_dissertation_council.surname: Иванов В. Т.
chairman_dissertation_council.position: Научный руководитель ИБХ РАН
chairman_dissertation_council.degree: Доктор химических наук
organization_supervisor.surname: Габибов А. Г.
organization_supervisor.position: Директор
organization_supervisor.degree: Доктор химических наук
rubrics.code: 34.15.05
rubrics.name: Методы и аппаратура в молекулярной биологии
rubrics.code: 34.15.33
rubrics.name: Молекулярная иммунология
rubrics.code: 34.43.15
rubrics.name: Сравнительная иммунология
oecds.code: 03.01.NI
oecds.name: IMMUNOLOGY
oecds.code: 01.06.CQ
oecds.name: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
oecds.code: 01.00.00
oecds.name: Natural Sciences
speciality_codes.name: Молекулярная биология
speciality_codes.code: 03.01.03
supervisors.fio: Британова О.В.
supervisors.scientific_degree: Кандидат биологических наук
supervisors.speciality_code: Молекулярная биология
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Казанский Д.Б.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Онкология
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Касьянов А.С.
opponents.scientific_degree: Кандидат физико-математических наук
opponents.speciality_code: Молекулярная биология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИБХ РАН
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук
protection_organization.ogrn: 1037739009110
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения
author_organization.short_name: ИБХ РАН
author_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук
author_organization.ogrn: 1037739009110
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Федеральные государственные бюджетные учреждения