name: Роль границ в установлении специфических взаимодействий между энхансерами и промотором гена Abd-B Drosophila melanogaster
keyword_list: CTCF Инсуляторы Границы Регуляция транскрипции Энхансеры Дистанционные взаимодействия Abd-B Bithorax Drosophila
abstract: Обеспечение правильной программы экспрессии генов в процессе развития многоклеточных организмов требует точной и эффективной системы регуляции. На уровне транскрипции такая регуляция осуществляется в результате взаимодействия нескольких типов цис-регуляторных элементов: промоторов, энхансеров, сайленсеров и инсуляторов. Без ответа пока остаются вопросы о том, каким образом происходит взаимодействия между регуляторными элементами, и что определяет специфичность взаимодействия между только определёнными энхансерами и промоторами. Было предположено, что инсуляторы, основным свойством которых является способность неспецифично блокировать взаимодействия между энхансерами и промоторами, участвуют в формировании границ доменов (Rao et al., 2014).
  Комплекс bithorax (BX-C), состоящий из трёх гомеозисных генов: Ubx, abd-A и Abd-B, является удобной моделью для исследования механизмов, обеспечивающих специфичность дистанционных взаимодействий между энхансерами и промоторами. Регуляторная область ВХ-С делится на девять iab-доменов, содержащих сегмент-специфичные энхансеры, отвечающие за морфологические особенности девяти задних сегментов тела дрозофилы. Каждый из трёх генов регулируется своим набором iab-энхансеров, активирующихся в разных сегментах. Соседние iab-домены, находящиеся в разном статусе активности (активный и репрессированный) в пределах одного сегмента, изолированы границами, которые имеют свойства инсуляторов. Возникает парадокс: iab-энхансеры, несмотря на изоляцию инсуляторами границ преодолевают их действие и способны активировать нужный промотор. Была выдвинута модель регуляции ВХ-С, по которой границы доменов выполняют не только изолирующую функцию, но и путём взаимодействия с предпромоторной областью соответствующего гена обеспечивают правильное взаимодействие сегмент-специфичных энхансеров с промотором (Kyrchanova et al., 2015). В данной работе впервые показано, что замена границы одной регуляторной области на границу другой приводит к перенаправлению энхансеров на другой промотор.
  В составе большинства подтверждённых и предполагаемых границ ВХ-С были обнаружены сайты связывания белка dCTCF (Holohan et al., 2007). В данной работе было показано, что четыре сайта связывания dCTCF не могут самостоятельно функционировать в качестве инсулятора в традиционно используемой трансгенной модельной системе с генами yellow и white, но в то же время их достаточно для обеспечения инсуляции в контексте BX-C, в том числе и для того, чтобы полностью функционально заместить инсулятор границы Mcp.
chairman_dissertation_council.name: Георгий
chairman_dissertation_council.surname: Георгиев
chairman_dissertation_council.patronymic: Павлович
chairman_dissertation_council.position: г.н.с., советник РАН
chairman_dissertation_council.degree: Доктор биологических наук
chairman_dissertation_council.rank: Академик
chairman_dissertation_council.wos_research_id: '-'
chairman_dissertation_council.scopus_author_id: 35600686700
chairman_dissertation_council.rinc_id: 84954
chairman_dissertation_council.territory: РОССИЯ
organization_supervisor.name: Павел
organization_supervisor.surname: Георгиев
organization_supervisor.patronymic: Георгиевич
organization_supervisor.position: директор
organization_supervisor.territory: РОССИЯ
rubrics.code: 34.15.25
rubrics.name: Молекулярная биология гена
rubrics.code: 34.15.23
rubrics.name: Молекулярная генетика
oecds.code: 01.06.CQ
oecds.name: BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY
oecds.code: 01.06.HY
oecds.name: DEVELOPMENTAL BIOLOGY
oecds.code: 01.06.KM
oecds.name: GENETICS & HEREDITY
speciality_codes.name: Молекулярная генетика
speciality_codes.code: 03.01.07
supervisors.fio: Кырчанова О.В.
supervisors.scientific_degree: Кандидат биологических наук
supervisors.speciality_code: Молекулярная генетика
supervisors.responsible_type: Научный руководитель
opponents.fio: Клёнов М.С.
opponents.scientific_degree: Кандидат биологических наук
opponents.speciality_code: Молекулярная биология
opponents.responsible_type: Оппонент
opponents.fio: Зацепина О.Г.
opponents.scientific_degree: Доктор биологических наук
opponents.speciality_code: Молекулярная биология
opponents.responsible_type: Оппонент
protection_organization.short_name: ИБГ РАН
protection_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биологии гена Российской академии наук
protection_organization.ogrn: 1027739618037
protection_organization.organization_type: Организация
protection_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
protection_organization.okopf: Учреждения
author_organization.short_name: ИБГ РАН
author_organization.name: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биологии гена Российской академии наук
author_organization.ogrn: 1027739618037
author_organization.organization_type: Организация
author_organization.okogu: Министерство науки и высшего образования Российской Федерации
author_organization.okopf: Учреждения